RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 DUOX1Q9NRD9 1551 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 MACROD2A1Z1Q3 448 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 C6orf229H3BNL8 230 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 EHD2Q9NZN4 543 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 H3BQF6 201 aa9.77□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 DOK7Q18PE1 504 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 FERMT2Q96AC1 680 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 AK7Q96M32 723 aa9.77□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 RABEP2Q9H5N1 569 aa9.77□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 SMCO2A6NFE2 343 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 TDP2O95551 362 aa9.76□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 OAS2P29728 719 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.852e-7■■■■■ 26.8
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GINS1-201ENST00000262460 SYCP1Q15431 976 aa9.76□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 TEX11Q8IYF3 940 aa9.76□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.76□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 KANK3Q6NY19 840 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.76□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 STXBP3O00186 592 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 SLC37A4O43826 429 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 KIF5CO60282 957 aa9.75□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 PDE4DQ08499 809 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 TCP10Q12799 353 aa9.75□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 TBCKQ8TEA7 893 aa9.75□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 DOCK2Q92608 1830 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 LRP5O75197 1615 aa9.75□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 EFCAB8A8MWE9 144 aa9.75□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
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GINS1-201ENST00000262460 ARID5AQ03989 594 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 TRIML1Q8N9V2 468 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 POLLQ9UGP5 575 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 CENPFP49454 3210 aa9.74□□□□□ -0.85
GINS1-201ENST00000262460 RASSF10A6NK89 507 aa9.74□□□□□ -0.85
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