RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031377.8

Scarb2-201, Transcript of Lysosome membrane protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scarb2, Length 4,698 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dph5Q9CWQ0 281 aa14.94□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 AacsQ9D2R0 672 aa14.94□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gjb4Q02738 266 aa14.94□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Arhgef16Q3U5C8 713 aa14.94□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Exoc3Q6KAR6 755 aa14.94□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Myl7Q9QVP4 175 aa14.94□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 EcsitQ9QZH6 435 aa14.94□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tagap1P0CAX8 505 aa14.94□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Slc9a1Q61165 820 aa14.94□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fgfr1opQ66JX5 399 aa14.94□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pramel6Q810Y9 485 aa14.94□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zfp174B9EJW5 407 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 AdkP55264 361 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Chp1P61022 195 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Drc1Q3USS3 753 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tsr1Q5SWD9 803 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 GypcQ78HU7 95 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pm20d1Q8C165 503 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Eif4a3Q91VC3 411 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cetn2Q9R1K9 172 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm38392E9Q2A2 434 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tcp1P11983 556 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ano9P86044 747 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Naa35Q6PHQ8 725 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Slc51bQ80WK2 128 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Hsf2bpQ9D4G2 338 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Adarb2Q9JI20 745 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Qtrt2B8ZXI1 415 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zscan18E9PUD6 809 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gucy1a2F8VQK3 730 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mtmr6Q8VE11 617 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dbndd2Q9CRD4 158 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gja10Q9WUS4 505 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Lcmt1A0A0U1RNF2 332 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Lrrc32G3XA59 663 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Il15P48346 162 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 NntQ61941 1086 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 HmcesQ8R1M0 353 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rrp1bQ91YK2 724 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Snrnp35Q9D384 244 aa14.93□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cdh15P33146 784 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cep70Q6IQY5 616 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pabpc4Q6PHQ9 660 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Slfnl1Q8BHW9 410 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fam228aQ8CDW1 299 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 GlyctkQ8QZY2 523 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Vsnl1P62761 191 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ehbp1Q69ZW3 1231 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nme8Q715T0 586 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Stac3Q8BZ71 360 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rcor2Q8C796 523 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Lzts2Q91YU6 671 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Trmt112Q9DCG9 125 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Col20a1Q923P0 1320 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cdc27A2A6Q5 825 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Apol6B7ZC55 329 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rasal2E9PW37 1286 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dok7Q18PE0 504 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dpp8Q80YA7 892 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pex11aQ9Z211 246 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Hps5P59438 1126 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Msl1Q6PDM1 616 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 GopcQ8BH60 463 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Saal1Q9D2C2 474 aa14.92□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 LrmpQ60664 539 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Bola2Q8BGS2 86 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Micall1Q8BGT6 870 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Usp11Q99K46 921 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Spef2Q8C9J3 1734 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 DohhA0A1Y7VJ29 135 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ugt1a8D3Z748 530 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ugt1a10E9PXN7 530 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tpp1O89023 562 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zfp42P22227 288 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Prl2c1Q5SVL9 228 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Creb3l3Q91XE9 479 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rwdd2aQ9D9S3 292 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm2030D3Z7C4 212 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Fam89aQ14BJ1 175 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Usp13Q5BKP2 858 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sp4Q62445 782 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ankrd13aQ80UP5 588 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 SncbQ91ZZ3 133 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mcur1Q9CXD6 340 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sgpp1Q9JI99 430 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Krt71Q9R0H5 524 aa14.91□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gdap1O88741 358 aa14.9□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Krt18P05784 423 aa14.9□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cyp2d9P11714 504 aa14.9□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Xrcc6P23475 608 aa14.9□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Traf1P39428 409 aa14.9□□□□□ -0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Krt86P97861 486 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.8 ms