RNA–Protein interactions for RNA: YMR014W

BUD22, Transcript of Protein required for rRNA maturation and ribosomal subunit biogenesis, yeast

Gene BUD22, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD22	YMR014W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	GGA1	Q06336	557 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	ARP7	Q12406	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	RHO2	P06781	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	NMT1	P14743	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	CLB3	P24870	427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	RAD14	P28519	371 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YSC84	P32793	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	CSE2	P33308	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YHR202W	P38887	602 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	MNN1	P39106	762 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	FHL1	P39521	936 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YJR061W	P40355	935 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	FMP33	P46998	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	VPS25	P47142	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	TEP1	P53916	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	SIW14	P53965	281 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	INP2	Q03824	705 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	RUP1	Q12242	671 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	SVS1	Q12254	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	OCA6	Q12454	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	URA4	P20051	364 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	ATP7	P30902	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	TFC1	P32367	649 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	HES1	P35843	434 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YBR284W	P38150	797 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	MRP21	P38175	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	ECM13	P38195	257 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	ARN1	P38731	627 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	BEM4	P39011	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	CDC1	P40986	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	STB4	P50104	949 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	SAM37	P50110	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	PEX8	P53248	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	SLM2	P53955	656 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	ROT1	Q03691	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	MCH5	Q08777	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	NSL1	Q12143	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	DGR2	P32330	852 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	AEP1	P32493	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
BUD22	YMR014W	POA1	P38218	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	ATG12	P38316	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YHI9	P38765	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	HAT2	P39984	401 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	ELO3	P40319	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	ATM1	P40416	690 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YJR142W	P47173	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	CDC14	Q00684	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	OSH6	Q02201	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	PET117	Q02771	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	NHP10	Q03435	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	ACL4	Q03771	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	ARP9	Q05123	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	SEC10	Q06245	871 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	PGC1	Q08959	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	PUS9	Q12069	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	LDB17	Q12342	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	APM4	Q99186	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	APE1	P14904	514 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	ADY2	P25613	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	CSM1	P25651	190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	VPH2	P32341	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BUD22	YMR014W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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