RNA–Protein interactions for RNA: YGL196W

DSD1, Transcript of D-serine dehydratase (aka D-serine ammonia-lyase), yeast

Gene DSD1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSD1	YGL196W	REC107	P21651	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	GSY2	P27472	705 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	EMP70	P32802	667 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	MNN2	P38069	597 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	AFG3	P39925	761 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	YEL020C	P39994	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	ALG5	P40350	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
DSD1	YGL196W	SAE2	P46946	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	GND2	P53319	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	CIK1	Q01649	594 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	THI3	Q07471	609 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
DSD1	YGL196W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	GAL80	P04387	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	MAK32	P23060	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	APE4	P38821	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	ELO1	P39540	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	JEM1	P40358	645 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	DOT5	P40553	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	SSU1	P41930	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	PET130	P47065	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	BI2	P03873	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	YCR051W	P25631	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	YMC1	P32331	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	APD1	P38281	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	PAC2	P39937	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	CDC1	P40986	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	YFR020W	P43600	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	YPR003C	P53394	754 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	ERO1	Q03103	563 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	VTA1	Q06263	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	IRC10	Q08118	586 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	APL4	Q12028	832 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	APN1	P22936	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	SAS3	P34218	831 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	NUP133	P36161	1157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	FTH1	P38310	465 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	TSC10	P38342	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	LTP1	P40347	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	YIL166C	P40445	542 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	HXT14	P42833	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	YJL043W	P47053	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	SGF73	P53165	657 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	ARO10	Q06408	635 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	RLM1	Q12224	676 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	STE50	P25344	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	BOS1	P25385	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	IMG1	P25626	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	PMT1	P33775	817 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	GCS1	P35197	352 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	STB6	P36085	766 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
DSD1	YGL196W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	RTT109	Q07794	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	MRP13	P12686	339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	CLB1	P24868	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	ICS2	P38284	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	MAF1	P41910	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	PTR3	P43606	678 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	ORC5	P50874	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	IPI3	P53877	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	CHO1	P08456	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	RAP1	P11938	827 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	CLB2	P24869	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	BUD14	P27637	709 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	MSS51	P32335	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	CIN4	P39110	191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DSD1	YGL196W	CIN1	P40987	1014 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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