RNA–Protein interactions for RNA: YGL009C

LEU1, Transcript of Isopropylmalate isomerase, yeast

Gene LEU1, Length 2,340 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LEU1	YGL009C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	IME1	P21190	360 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	EMC1	P25574	760 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	MEI5	P32489	222 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	STB6	P36085	766 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	MRPL36	P36531	177 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	FLC2	P39719	783 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	GID8	P40208	455 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	IAH1	P41734	238 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	YFL066C	P43538	392 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	SIP4	P46954	829 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	PUS2	P53167	370 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	TIM21	P53220	239 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	AAD4	Q07747	329 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	RSB1	Q08417	382 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	SVS1	Q12254	260 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	HER1	Q12276	1246 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	NUP192	P47054	1683 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LEU1	YGL009C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	LRO1	P40345	661 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	URB2	P47108	1174 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	EXG2	P52911	562 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	BSC5	P53755	489 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	GPR1	Q12361	961 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	CTF13	P35203	478 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	APN2	P38207	520 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	YHR182W	P38870	785 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	YDL183C	P48569	320 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	COQ6	P53318	479 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	SEG1	Q04279	960 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	HOS1	Q12214	470 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	GPM3	Q12326	303 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	SEC39	Q12745	709 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	RIT1	P23796	513 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	CLB1	P24868	471 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	MSP1	P28737	362 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	LRG1	P35688	1017 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	YKR015C	P36111	568 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	CEM1	P39525	442 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	SNX4	P47057	423 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	PEF1	P53238	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	VPS75	P53853	264 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	GIM5	Q04493	163 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	SNA4	Q07549	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	CRD1	Q07560	283 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	GRX6	Q12438	231 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	GCN4	P03069	281 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	RDS1	P25611	832 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	COT1	P32798	439 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	SRB2	P34162	210 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	OCT1	P35999	772 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	YHL017W	P38745	532 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	YIL089W	P40500	205 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	PDR11	P40550	1411 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	BST1	P43571	1029 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	SSN8	P47821	323 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	GCV2	P49095	1034 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	BIO3	P50277	480 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	PGA2	P53903	129 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	YDR444W	Q04093	687 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	SPC2	Q04969	178 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	MTC7	P32633	139 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	LHS1	P36016	881 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	DAD2	P36162	133 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	YHL012W	P38709	493 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	CUL3	P53202	744 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	SEC10	Q06245	871 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	BCP1	Q06338	283 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	SPE2	P21182	396 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LEU1	YGL009C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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