RNA–Protein interactions for RNA: YDR365C

ESF1, Transcript of Nucleolar protein involved in pre-rRNA processing, yeast

Gene ESF1, Length 1,887 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ESF1	YDR365C	ATG17	Q06410	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	THI22	Q06490	572 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	NBP2	Q12163	236 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	IES3	Q12345	250 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	PRC1	P00729	532 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	RPD3	P32561	433 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	SEF1	P34228	1148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	GPT2	P36148	743 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	VID24	P38263	362 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	RRT2	P38332	387 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	CCT6	P39079	546 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YIL089W	P40500	205 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	CAB2	P40506	365 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	MLC1	P53141	149 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YGR045C	P53229	120 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	TAM41	P53230	385 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	FYV6	P53913	173 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	MAK10	Q02197	733 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	DYN3	Q04949	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	STP3	Q05937	343 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	STE23	Q06010	1027 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	CRD1	Q07560	283 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	UAF30	Q08747	228 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	VCX1	Q99385	411 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	CAT8	P39113	1433 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	NMT1	P14743	455 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	CDC42	P19073	191 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	PMA2	P19657	947 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
ESF1	YDR365C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	PHO11	P35842	467 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	PHO12	P38693	467 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YHL017W	P38745	532 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YIL077C	P40508	320 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YIR007W	P40566	764 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YFL066C	P43538	392 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	AAD10	P47182	288 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	SPP1	Q03012	353 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	ASM4	Q05166	528 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	TPK2	P06245	380 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	PDE2	P06776	526 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	OCT1	P35999	772 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	TPO5	P36029	618 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	VPS51	P36116	164 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	MRPL16	P38064	232 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	POA1	P38218	177 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	REG2	P38232	338 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	NPA3	P47122	385 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YGR111W	P53265	400 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	ADY4	Q05955	493 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	TMA16	Q08687	178 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	ATP16	Q12165	160 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YPT6	Q99260	215 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	LRG1	P35688	1017 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	GEX2	P36173	615 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	MNN2	P38069	597 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YHR033W	P38690	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	TDA11	P38854	504 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	FCY21	P40039	528 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	SER3	P40054	469 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	SLZ1	P40167	298 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	GSM1	P42950	618 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	EFM3	P47163	339 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	GCV1	P48015	400 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YNL144C	P53907	740 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	MUB1	Q03162	620 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	FIN1	Q03898	291 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YEH1	Q07804	573 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	XYL2	Q07993	356 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ESF1	YDR365C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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