RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W ELF1P36053 145 aa5.65□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data5.65□□□□□ -1.51not detected
VHS1YDR247W SUL1P38359 859 aa5.65□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W UBP5P39944 805 aa5.65□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W DPH1P40487 425 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YFH7P43591 353 aa5.65□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W AVT1P47082 602 aa5.65□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W URB2P47108 1174 aa5.65□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W PSP1P50896 841 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W ESF2P53743 316 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SPC24Q04477 213 aa5.65□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YLR040CQ07988 224 aa5.65□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W COX17Q12287 69 aa5.65□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W NTO1Q12311 748 aa5.65□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W MED1Q12321 566 aa5.65□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W ILV6P25605 309 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W CTS1P29029 562 aa5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W ZUO1P32527 433 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data5.64□□□□□ -1.51not detected
VHS1YDR247W SAS3P34218 831 aa5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YBR062CP38239 180 aa5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W RCK2P38623 610 aa5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SMX2P40204 77 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W TMA22P47089 198 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YGR151CP53287 111 aa5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W BNI5P53890 448 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YML119WQ03208 357 aa5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W CSM3Q04659 317 aa5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SUL2Q12325 893 aa5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W NCA2Q12374 616 aa5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SEY1Q99287 776 aa5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W FLO1P32768 1537 aa5.64□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W FUM1P08417 488 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SNF3P10870 884 aa5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W MRPS28P21771 286 aa5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SAN1P22470 610 aa5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W CBF2P32504 956 aa5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W PAH1P32567 862 aa5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W PPS1P38148 807 aa5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YEL068CP39977 110 aa5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W NOP16P40007 231 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W ARB1P40024 610 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W ZAP1P47043 880 aa5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SPO19Q03029 223 aa5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SNO4Q04902 237 aa5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W TSR1Q07381 788 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W HSP33Q08914 237 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W HSP32Q08992 237 aa5.63□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W PMD1P32634 1753 aa5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SRV2P17555 526 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W BUD14P27637 709 aa5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W NIP1P32497 812 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W NUP120P35729 1037 aa5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W APL3P38065 1025 aa5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W NDE1P40215 560 aa5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W RIC1P40395 1056 aa5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SKP2P42843 763 aa5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W TDA10P42938 290 aa5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W NMD5P46970 1048 aa5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W DIP5P53388 608 aa5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W MFM1Q02783 413 aa5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W UFO1Q04511 668 aa5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W TCO89Q08921 799 aa5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W PCD1Q12524 340 aa5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W HKR1P41809 1802 aa5.62□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W GCD2P12754 651 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W KAR3P17119 729 aa5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YCR061WP25639 631 aa5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W KRE2P27809 442 aa5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SMY1P32364 656 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YME1P32795 747 aa5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W TIF4631P39935 952 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YIL001WP40560 513 aa5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W VPS4P52917 437 aa5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W COG1P53079 417 aa5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W ATG4P53867 494 aa5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W UTP6Q02354 440 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W TDA9Q04545 1251 aa5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W FAR8Q05040 523 aa5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YLH47Q06493 454 aa5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YOL073CQ08232 322 aa5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W OSW1Q08692 278 aa5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W RKI1Q12189 258 aa5.61□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YLR462WO13556 202 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W AAC3P18238 307 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W PMI40P29952 429 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W DPH5P32469 300 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W BLI1P35727 113 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YKL050CP35736 922 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W FZO1P38297 855 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YHL049CP38722 271 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YEL075CP39972 122 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W YER189WP40104 122 aa5.6□□□□□ -1.51
VHS1YDR247W SDS3P40505 327 aa5.6□□□□□ -1.51
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