RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	JJJ1	P53863	590 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RSC9	Q03124	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	GET4	Q12125	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	MAK31	P23059	88 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	ANP1	P32629	500 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	MTC7	P32633	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	TOA1	P32773	286 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RIB7	P33312	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	JNM1	P36224	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	SPL2	P38839	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RET2	P43621	546 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	STB2	P46679	850 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YJR096W	P47137	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YJR120W	P47157	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	BRO1	P48582	844 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	COQ6	P53318	479 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	COS6	P53344	381 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	SHR3	Q02774	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	ATG17	Q06410	417 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	AIM41	Q12032	185 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RTP1	Q12751	981 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	HKR1	P41809	1802 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	EUG1	P32474	517 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	ATO2	P32907	282 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	XRS2	P33301	854 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	BUD2	P33314	1104 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	AST1	P35183	429 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	FMP33	P46998	180 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	FMS1	P50264	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	NSE1	Q07913	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	VIK1	Q12045	647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	MSH5	Q12175	901 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	BLI1	P35727	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YKR015C	P36111	568 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	CKB2	P38930	258 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	HXT7	P39004	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	PRM2	P40534	656 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YFL015C	P43578	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	TOS3	P43637	560 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	POL31	P46957	487 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	TAF4	P50105	388 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RTS3	P53289	263 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RET3	P53600	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	OSH6	Q02201	448 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	PPM1	Q04081	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	HLR1	Q04429	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	DON1	Q05610	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	ARR1	Q06596	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	IES3	Q12345	250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	HIF1	Q12373	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YPT6	Q99260	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YLR462W	O13556	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	CYB2	P00175	591 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	PET122	P10355	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YAK1	P14680	807 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	HEM15	P16622	393 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	CKA2	P19454	339 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	HOP1	P20050	605 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	URA4	P20051	364 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	FLO1	P32768	1537 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	MRE11	P32829	692 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	EHT1	P38295	451 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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