RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614459.4

MDM4-215, Transcript of MDM4, p53 regulator, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM4, Length 9,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM4-215	ENST00000614459	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	HSPA2	P54652	639 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	RETREG2	Q8NC44	543 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459		H0Y626	953 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	SPTLC2	O15270	562 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	TRIM16	O95361	564 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	SMARCA1	P28370	1054 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	PPP2R1A	P30153	589 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	SLFN5	Q08AF3	891 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	NECAB1	Q8N987	351 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	FAM81B	Q96LP2	452 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	SLC4A2	P04920	1241 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	CUL7	Q14999	1698 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	SPATA1	Q5VX52	437 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	SH3BP5	O60239	455 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	MED21	Q13503	144 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	ATG16L1	Q676U5	607 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	CCDC125	Q86Z20	511 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	GOLGA8R	I6L899	631 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	KLC3	Q6P597	504 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	TMX1	Q9H3N1	280 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	KLHL31	Q9H511	634 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		7.84	□□□□□ -1.15
MDM4-215	ENST00000614459	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		7.84	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	SCG2	P13521	617 aa		7.84	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	ATIC	P31939	592 aa		7.84	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	KLC1	Q07866	573 aa		7.84	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	RPS6KA1	Q15418	735 aa		7.84	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		7.84	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		7.84	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	POTEA	Q6S8J7	498 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	EPC1	Q9H2F5	836 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	FANCA	O15360	1455 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	CAV1	Q03135	178 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	FSCB	Q5H9T9	825 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	NCOA7	Q8NI08	942 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	TRIM11	Q96F44	468 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	COQ7	Q99807	217 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	KRT15	P19012	456 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	SNX1	Q13596	522 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	CERS3	Q8IU89	383 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	NCOA1	Q15788	1441 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	BNC1	Q01954	994 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	STK3	Q13188	491 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	CDR2	Q01850	454 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	KLHL29	Q96CT2	875 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		7.83	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	CUL4B	Q13620	913 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	TINF2	Q9BSI4	451 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	CCT5	P48643	541 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	RILP	Q96NA2	401 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	IFNK	Q9P0W0	207 aa		7.82	□□□□□ -1.16
MDM4-215	ENST00000614459	S100A1	P23297	94 aa		7.82	□□□□□ -1.16

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 173.5 ms