RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	ARID5A	Q03989	594 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	FEZ1	Q99689	392 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	HLA-DOA	P06340	250 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	NTRK3	Q16288	839 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	UVSSA	Q2YD98	709 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC174	Q6PII3	467 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC93	Q567U6	631 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTCFL-222	ENST00000609232	RHBDL3	P58872	404 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM260	Q9NX78	707 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	WNT7A	O00755	349 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	VPS16	Q9H269	839 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	CACNA1S	Q13698	1873 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	KLRF2	D3W0D1	207 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	PTGDR	Q13258	359 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	DGKZ	Q13574	1117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	MTA3	Q9BTC8	594 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	TEC	P42680	631 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A0C4DFX4	3053 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	DDAH1	O94760	285 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF76	P36508	570 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	UBA7	P41226	1012 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP4A11	Q02928	519 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	TROAP	Q12815	778 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	OGFOD1	Q8N543	542 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	PIGS	Q96S52	555 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	CSRNP2	Q9H175	543 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	DOCK2	Q92608	1830 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	ELP1	O95163	1332 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	USP17L5	A8MUK1	530 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	RASA1	P20936	1047 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP2R5B	Q15173	497 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	DRC1	Q96MC2	740 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM75P	A6NK02	468 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	DESI2	Q9BSY9	194 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	CASZ1	Q86V15	1759 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	GAK	O14976	1311 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	USP17L15	C9J2P7	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	USP17L11	C9JVI0	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	USP17L18	D6R9N7	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	USP17L22	D6RA61	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	USP17L19	D6RCP7	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	USP17L20	D6RJB6	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	PRR29	P0C7W0	189 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	TNNT1	P13805	278 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63	3e-6	■■□□□ 13.2
CTCFL-222	ENST00000609232	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	USP17L24	Q0WX57	530 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	FANCL	Q9NW38	375 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC66	A2RUB6	948 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	DGKH	Q86XP1	1220 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	KIFC2	Q96AC6	838 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	CEP95	Q96GE4	821 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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