RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571303.1

MLKL-204, Transcript of mixed lineage kinase domain like pseudokinase, human

TSL 3

Gene MLKL, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLKL-204	ENST00000571303	PPARA	Q07869	468 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MLKL-204	ENST00000571303	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
MLKL-204	ENST00000571303	TRIM60	Q495X7	471 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MLKL-204	ENST00000571303	MKL1	Q969V6	931 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MLKL-204	ENST00000571303	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
MLKL-204	ENST00000571303	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
MLKL-204	ENST00000571303	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MLKL-204	ENST00000571303	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MLKL-204	ENST00000571303	NAPB	Q9H115	298 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MLKL-204	ENST00000571303	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
MLKL-204	ENST00000571303	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
MLKL-204	ENST00000571303	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MLKL-204	ENST00000571303	FOXP2	O15409	715 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	ZBED4	O75132	1171 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	TTLL1	O95922	423 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	TSPY3	P0CV98	308 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	TSPY8	P0CW00	308 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	RARB	P10826	455 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	COPB2	P35606	906 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	TFAP4	Q01664	338 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	SLFN13	Q68D06	897 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	DEFB123	Q8N688	67 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	LTBP2	Q14767	1821 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	PDE4B	Q07343	736 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	SNX17	Q15036	470 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	FEM1B	Q9UK73	627 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	TMEM232	C9JQI7	657 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	BMP3	P12645	472 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	VPS53	Q5VIR6	699 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	GPR153	Q6NV75	609 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	PHF24	Q9UPV7	400 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		13.06	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	MCM3AP	O60318	1980 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	NMT2	O60551	498 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	AKR1A1	P14550	325 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	MCC	P23508	829 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	SNAP25	P60880	206 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	TLE2	Q04725	743 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	RNF180	Q86T96	592 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	BAD	Q92934	168 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	FGD4	Q96M96	766 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.05	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303		A0A1W2PQY0	241 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	ITGB8	P26012	769 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	PDE1A	P54750	535 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	SHH	Q15465	462 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	KCTD1	Q719H9	257 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	FAM227B	Q96M60	508 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		13.04	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	COL6A3	P12111	3177 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	MYADML2	A6NDP7	307 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	ADCY6	O43306	1168 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	SLC1A4	P43007	532 aa		13.03	□□□□□ -0.32
MLKL-204	ENST00000571303	STAT2	P52630	851 aa		13.03	□□□□□ -0.32

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms