RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549258.5

SLC38A2-208, Transcript of solute carrier family 38 member 2, human

TSL 2

Gene SLC38A2, Length 4,384 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A2-208	ENST00000549258	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258		A0A0B4J203	849 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	NDUFAB1	O14561	156 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CHUK	O15111	745 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SNX16	P57768	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	C8orf34	Q49A92	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	PANK1	Q8TE04	598 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	NELL1	Q92832	810 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ARHGEF10	O15013	1369 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	RASA4B	C9J798	803 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	AKR1B10	O60218	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	VAMP4	O75379	141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	A1BG	P04217	495 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	YY1	P25490	414 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	LIG3	P49916	1009 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	LRP8	Q14114	963 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	IL25	Q9H293	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	STAM2	O75886	525 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CNGA3	Q16281	694 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	HLF	Q16534	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	RELN	P78509	3460 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	NEMF	O60524	1076 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CCNC	P24863	283 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	USP11	P51784	963 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	TAF11	Q15544	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	APPBP2	Q92624	585 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	HAUS7	Q99871	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	DISC1	Q9NRI5	854 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	NHS	Q6T4R5	1651 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	CUL3	Q13618	768 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	WASHC4	Q2M389	1173 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SLC38A2-208	ENST00000549258	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68	1e-21	■■■■□ 25.8

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