RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 TIFAQ96CG3 184 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-204ENST00000548823 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-204ENST00000548823 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-204ENST00000548823 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-204ENST00000548823 BTBD7Q9P203 1132 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDSP2-204ENST00000548823 LAMA4Q16363 1823 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDSP2-204ENST00000548823 KIAA0355O15063 1070 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDSP2-204ENST00000548823 RAG1P15918 1043 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDSP2-204ENST00000548823 PLCG2P16885 1265 aa23.46■■□□□ 1.35
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CTDSP2-204ENST00000548823 BAG3O95817 575 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 UBE3CQ15386 1083 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 PI16Q6UXB8 463 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 FEZ1Q99689 392 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 MYO9BQ13459 2157 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 STRNO43815 780 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 ADD2P35612 726 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 USP14P54578 494 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 CLEC17AQ6ZS10 378 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 PHF24Q9UPV7 400 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 FLT1P17948 1338 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 GH2P01242 217 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 ADORA2AP29274 412 aa23.43■■□□□ 1.34
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CTDSP2-204ENST00000548823 OSBP2Q969R2 916 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.43■■□□□ 1.34
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CTDSP2-204ENST00000548823 CHGBP05060 677 aa23.42■■□□□ 1.34
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CTDSP2-204ENST00000548823 VCAM1P19320 739 aa23.42■■□□□ 1.34
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CTDSP2-204ENST00000548823 ANKRD1Q15327 319 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 HLA-DOAP06340 250 aa23.41■■□□□ 1.34
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CTDSP2-204ENST00000548823 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.41■■□□□ 1.34
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CTDSP2-204ENST00000548823 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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CTDSP2-204ENST00000548823 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
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CTDSP2-204ENST00000548823 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 CYP21A2P08686 494 aa23.4■■□□□ 1.34
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CTDSP2-204ENST00000548823 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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CTDSP2-204ENST00000548823 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-204ENST00000548823 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.39■■□□□ 1.33
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CTDSP2-204ENST00000548823 COBLO75128 1261 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.38■■□□□ 1.33
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CTDSP2-204ENST00000548823 RNF180Q86T96 592 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 TOX2Q96NM4 488 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 NEK1Q96PY6 1258 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 PBX4Q9BYU1 374 aa23.38■■□□□ 1.33
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CTDSP2-204ENST00000548823 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 PDE6AP16499 860 aa23.37■■□□□ 1.33
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CTDSP2-204ENST00000548823 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.335e-7■■□□□ 13
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CTDSP2-204ENST00000548823 A0A1W2PQY0 241 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 RARBP10826 455 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 ERCC3P19447 782 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 PBX2P40425 430 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 FAAP100Q0VG06 881 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDSP2-204ENST00000548823 ACER1Q8TDN7 264 aa23.36■■□□□ 1.33
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