RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 UBAC1Q9BSL1 405 aa6.6□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.6□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.6□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.6□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.6□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PRG0 241 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 VWA5AO00534 786 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 PLA2G6O60733 806 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 HOXC6P09630 235 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 ERCC3P19447 782 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPREP23469 700 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 JAG1P78504 1218 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 MORN1Q5T089 497 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM83BQ5T0W9 1011 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 TTC22Q5TAA0 569 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF20Q5VTR2 975 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 OLFML2BQ68BL8 750 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 NECAB2Q7Z6G3 386 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 DGKHQ86XP1 1220 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 CHST13Q8NET6 341 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 DCAF4Q8WV16 495 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP95Q96GE4 821 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 GMCL1Q96IK5 515 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM227BQ96M60 508 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 MMP19Q99542 508 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 MAF1Q9H063 256 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 KAT14Q9H8E8 782 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 SPC25Q9HBM1 224 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 GJD2Q9UKL4 321 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 GABRQQ9UN88 632 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 MGAMO43451 1857 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 PFASO15067 1338 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A0D9SFI3 127 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM232C9JQI7 657 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP2A1O14983 1001 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 NDUFB10O96000 172 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ELNP15502 786 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ADORA2AP29274 412 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CNGA1P29973 690 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 GRB14Q14449 540 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC96Q2M329 555 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 Q3C1V9 767 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 KIFC2Q96AC6 838 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 NBPF3Q9H094 633 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 LOC285556D6RIA3 1793 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPRFP10586 1907 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 MYH8P13535 1937 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ASB14A6NK59 587 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 KBTBD13C9JR72 458 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 FGRP09769 529 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 MCCP23508 829 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 TMTC2Q8N394 836 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ATG4CQ96DT6 458 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 DEFB118Q96PH6 123 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 PORCNQ9H237 461 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 ACAD9Q9H845 621 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 BTBD7Q9P203 1132 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-215ENST00000544584 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms