RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 PTGDRQ13258 359 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF446Q9NWS9 450 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 ATRNO75882 1429 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 STK36Q9NRP7 1315 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 BMP15O95972 392 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 CDC25AP30304 524 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 SEC23AQ15436 765 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 TEX35Q5T0J7 233 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 DGKHQ86XP1 1220 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 PROM2Q8N271 834 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 CNKSR1Q969H4 720 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM47Q9BQJ4 181 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 MTA3Q9BTC8 594 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 PAPPAQ13219 1627 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 CAND2O75155 1236 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 E2F4Q16254 413 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 TMC6Q7Z403 805 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 CEP95Q96GE4 821 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 UIMC1Q96RL1 719 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 C6orf50Q9HD87 102 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 SPTLC3Q9NUV7 552 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 IFNKQ9P0W0 207 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 DACH1Q9UI36 760 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 EP400Q96L91 3159 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 PPP6R2O75170 966 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 BAG6P46379 1132 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 TNNI2P48788 182 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 STX17P56962 302 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 INF2Q27J81 1249 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 LONRF3Q496Y0 759 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 SBK1Q52WX2 424 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 BLIDQ8IZY5 108 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 CSRNP2Q9H175 543 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 FLT1P17948 1338 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-208ENST00000519076 RAD17O75943 681 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 AOC3Q16853 763 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 TOP1P11387 765 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 ERCC3P19447 782 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 GNA11P29992 359 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 MAGEA9P43362 315 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF75DP51815 510 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 CRY2Q49AN0 593 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 KANK3Q6NY19 840 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 SHC4Q6S5L8 630 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 DEFB132Q7Z7B7 95 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 EPSTI1Q96J88 318 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 ETAA1Q9NY74 926 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 SMCO2A6NFE2 343 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 SETSIPP0DME0 302 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 ABCD1P33897 745 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 STAT6P42226 847 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 UBASH3AP57075 661 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 INHBEP58166 350 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 POSTNQ15063 836 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 KRBA2Q6ZNG9 492 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 SPEF2Q9C093 1822 aa8.83□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa8.82□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 CLRN2A0PK11 232 aa8.82□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 SLC1A4P43007 532 aa8.82□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 RCAN1P53805 252 aa8.82□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 GRIN1Q05586 938 aa8.82□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 PODNQ7Z5L7 613 aa8.82□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 SRLQ86TD4 932 aa8.82□□□□□ -1
TRPS1-208ENST00000519076 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
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