RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 ADD1P35611 737 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 CLN3Q13286 438 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 KIF22Q14807 665 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 LAPTM4AQ15012 233 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 TREML1Q86YW5 311 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 GPR152Q8TDT2 470 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 GGNBP2Q9H3C7 697 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 CABP1Q9NZU7 370 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5.09□□□□□ -1.59
SHQ1-208ENST00000482785 ADH1CP00326 375 aa5.08□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 NR3C2P08235 984 aa5.08□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 TATP17735 454 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 HSD3B2P26439 372 aa5.08□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.6
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SHQ1-208ENST00000482785 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.08□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 PODNQ7Z5L7 613 aa5.08□□□□□ -1.6
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SHQ1-208ENST00000482785 KIAA2013Q8IYS2 634 aa5.08□□□□□ -1.6
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SHQ1-208ENST00000482785 SPACA7Q96KW9 195 aa5.08□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 PHACTR1Q9C0D0 580 aa5.08□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
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SHQ1-208ENST00000482785 TONSLQ96HA7 1378 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 MYPNQ86TC9 1320 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 ELNP15502 786 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 IRS1P35568 1242 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 NBL1P41271 181 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 PSMC4P43686 418 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 PAK2Q13177 524 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 LRRC41Q15345 812 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 XKR5Q6UX68 686 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 CNBD1Q8NA66 436 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 RASGRP4Q8TDF6 673 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 HERVK_113Q902F9 699 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 CCDC74AQ96AQ1 378 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 SEC16BQ96JE7 1060 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
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SHQ1-208ENST00000482785 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa5.07□□□□□ -1.6
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SHQ1-208ENST00000482785 PKD2L1Q9P0L9 805 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 FZD1Q9UP38 647 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 COG5Q9UP83 839 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 NOTCH2Q04721 2471 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 DOCK3Q8IZD9 2030 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 MGAMO43451 1857 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 GBF1Q92538 1859 aa5.07□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 MAST2Q6P0Q8 1798 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 AOX1Q06278 1338 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 ADGRA2Q96PE1 1338 aa5.06□□□□□ -1.6
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SHQ1-208ENST00000482785 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 YDJCA8MPS7 323 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 NPHP1O15259 732 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 TNFRSF21O75509 655 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 ADH1AP07327 375 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
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SHQ1-208ENST00000482785 TCEAL1Q15170 157 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 PTPROQ16827 1216 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 JAZF1Q86VZ6 243 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 SNX29Q8TEQ0 813 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 DPF2Q92785 391 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 KCNB2Q92953 911 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 MKL1Q969V6 931 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 CLMNQ96JQ2 1002 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 JAG2Q9Y219 1238 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa5.06□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 CREBBPQ92793 2442 aa5.05□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 NAV3Q8IVL0 2385 aa5.05□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.05□□□□□ -1.6
SHQ1-208ENST00000482785 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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