RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480104.5

USP11-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 3

Gene USP11, Length 697 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-208ENST00000480104 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
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USP11-208ENST00000480104 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.73□□□□□ -0.05
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USP11-208ENST00000480104 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.73□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 MMP19Q99542 508 aa14.73□□□□□ -0.05
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USP11-208ENST00000480104 COL4A6Q14031 1691 aa14.73□□□□□ -0.05
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USP11-208ENST00000480104 TMEM221A6NGB7 291 aa14.72□□□□□ -0.05
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USP11-208ENST00000480104 ZBTB22O15209 634 aa14.72□□□□□ -0.05
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USP11-208ENST00000480104 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa14.72□□□□□ -0.05
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USP11-208ENST00000480104 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.72□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.72□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 PLXNA3P51805 1871 aa14.72□□□□□ -0.05
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USP11-208ENST00000480104 RALBP1Q15311 655 aa14.71□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 PKN1Q16512 942 aa14.71□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 MB21D1Q8N884 522 aa14.71□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 EDAQ92838 391 aa14.71□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 SPC25Q9HBM1 224 aa14.71□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP11-208ENST00000480104 PRR23AA6NEV1 266 aa14.7□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 PROB1E7EW31 1015 aa14.7□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 B4GALT4O60513 344 aa14.7□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 GJA9P57773 515 aa14.7□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.7□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 SIL1Q9H173 461 aa14.7□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 SUGCTQ9HAC7 445 aa14.7□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.7□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 TRPC6Q9Y210 931 aa14.7□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 FAM50BQ9Y247 325 aa14.7□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 FRYLO94915 3013 aa14.7□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 CTAGE5O15320 804 aa14.69□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 ACTN1P12814 892 aa14.69□□□□□ -0.06
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USP11-208ENST00000480104 RNF135Q8IUD6 432 aa14.69□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 FBXL6Q8N531 539 aa14.69□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 ATG4CQ96DT6 458 aa14.69□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.69□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.69□□□□□ -0.06
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USP11-208ENST00000480104 H0Y858 1186 aa14.68□□□□□ -0.06
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USP11-208ENST00000480104 KCTD2Q14681 263 aa14.68□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.68□□□□□ -0.06
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USP11-208ENST00000480104 FSD1Q9BTV5 496 aa14.68□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.68□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 TLR9Q9NR96 1032 aa14.68□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 RAI14Q9P0K7 980 aa14.68□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 SLC25A27O95847 323 aa14.67□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 DSG3P32926 999 aa14.67□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 ITGA7Q13683 1181 aa14.67□□□□□ -0.06
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USP11-208ENST00000480104 PI16Q6UXB8 463 aa14.67□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 SPTBN2O15020 2390 aa14.66□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.66□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.66□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.66□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.66□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.66□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 USP24Q9UPU5 2620 aa14.65□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 CEP250Q9BV73 2442 aa14.65□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 A0A1W2PRG0 241 aa14.65□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 FLOT1O75955 427 aa14.65□□□□□ -0.06
USP11-208ENST00000480104 GUCY1A2P33402 732 aa14.65□□□□□ -0.06
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