RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 SKAP1Q86WV1 359 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 NCOA7Q8NI08 942 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.25■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 SNHG28P0DPA3 235 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 WDR78Q5VTH9 848 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 KIFC2Q96AC6 838 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 MTA3Q9BTC8 594 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 PNMA2Q9UL42 364 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 PLXNB2O15031 1838 aa22.24■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 RNF20Q5VTR2 975 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.23■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 E7EWF7 191 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 INHAP05111 366 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 PDHBP11177 359 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 FCER1AP12319 257 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 CYP2B6P20813 491 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 CCDC96Q2M329 555 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 KAT14Q9H8E8 782 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 FBXO40Q9UH90 709 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 TNKSO95271 1327 aa22.22■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 ELNP15502 786 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 SOX10P56693 466 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 NECTIN1Q15223 517 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 TKFCQ3LXA3 575 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 KCTD1Q719H9 257 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 PNMA1Q8ND90 353 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 CHST13Q8NET6 341 aa22.21■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SYF2-203ENST00000474160 CENPFP49454 3210 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 ERICH2A1L162 156 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 GJB1P08034 283 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 ADORA2AP29274 412 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 ZNF543Q08ER8 600 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 DPP9Q86TI2 863 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.2■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 CCL5P13501 91 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 KCTD2Q14681 263 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 TRIB2Q92519 343 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 RPTORQ8N122 1335 aa22.19■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 SLC27A2O14975 620 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 SEC23AQ15436 765 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 MMP19Q99542 508 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 RNF208Q9H0X6 261 aa22.18■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 GJA8P48165 433 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 MTFR1Q15390 333 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 CPXCR1Q8N123 301 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 MTMR7Q9Y216 660 aa22.17■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 REC8O95072 547 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.16■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 POTEFA5A3E0 1075 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 IGHA2P01877 340 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 ICAM1P05362 532 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 MCM5P33992 734 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 KRT32Q14532 448 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 TMTC2Q8N394 836 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 TMEM87BQ96K49 555 aa22.15■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 ZNF536O15090 1300 aa22.14■■□□□ 1.14
SYF2-203ENST00000474160 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 WTAPQ15007 396 aa22.14■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.14■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 MAF1Q9H063 256 aa22.14■■□□□ 1.13
SYF2-203ENST00000474160 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 216.4 ms