RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
ACTB-208ENST00000464611 STYK1Q6J9G0 422 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTB-208ENST00000464611 TMC4Q7Z404 712 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTB-208ENST00000464611 ZNF804AQ7Z570 1209 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTB-208ENST00000464611 PPFIBP1Q86W92 1011 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTB-208ENST00000464611 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
ACTB-208ENST00000464611 CNGA4Q8IV77 575 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTB-208ENST00000464611 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTB-208ENST00000464611 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
ACTB-208ENST00000464611 TNFRSF25Q93038 417 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTB-208ENST00000464611 IQCDQ96DY2 449 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTB-208ENST00000464611 PAGE5Q96GU1 130 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTB-208ENST00000464611 AK8Q96MA6 479 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTB-208ENST00000464611 INCENPQ9NQS7 918 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTB-208ENST00000464611 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 H7C1D1 291 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 SRGNP10124 158 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ALDH1B1P30837 517 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 DPYDQ12882 1025 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 NR5A1Q13285 461 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 STIM1Q13586 685 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ARID5BQ14865 1188 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CCDC93Q567U6 631 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 C12orf60Q5U649 245 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ADGRA1Q86SQ6 560 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 FBXW7Q969H0 707 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CNKSR1Q969H4 720 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CRAMP1Q96RY5 1269 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 DNAI1Q9UI46 699 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 RWDD2AQ9UIY3 292 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 A0A1B0GUL6 1792 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 XDHP47989 1333 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 EFCAB8A8MWE9 144 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 SNAP23O00161 211 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CCDC175P0C221 793 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ATP1A3P13637 1013 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ATP2B4P23634 1241 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 USP5P45974 858 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 PTGDRQ13258 359 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 GRAPQ13588 217 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 KCNB1Q14721 858 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 GRM4Q14833 912 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 BLIDQ8IZY5 108 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 OXER1Q8TDS5 423 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 MARVELD3Q96A59 401 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 MKNK2Q9HBH9 465 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 MYO1AQ9UBC5 1043 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 USP27XA6NNY8 438 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 BBOX1O75936 387 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 DPEP1P16444 411 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 BMP6P22004 513 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 FECHP22830 423 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 GNA11P29992 359 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CHRNA5P30532 468 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CASQ1P31415 396 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 AMPD3Q01432 767 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 CUL4BQ13620 913 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 SOGA3Q5TF21 947 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 ISM2Q6H9L7 571 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 REXO1L1PQ8IX06 675 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 MNS1Q8NEH6 495 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 UBXN4Q92575 508 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 DHX58Q96C10 678 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTB-208ENST00000464611 LRRC27Q9C0I9 530 aa9.62□□□□□ -0.87
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