RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 GABRQQ9UN88 632 aa24.11■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 ATP2A1O14983 1001 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 FCER1AP12319 257 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 ERCC3P19447 782 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 PTPREP23469 700 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 MCM5P33992 734 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 CAP1Q01518 475 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 NECTIN1Q15223 517 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 KCTD1Q719H9 257 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 DPP9Q86TI2 863 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 FBXO40Q9UH90 709 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 GJD2Q9UKL4 321 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 SLC27A2O14975 620 aa24.09■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 KCTD2Q14681 263 aa24.09■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
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IMP4-209ENST00000462357 PDHBP11177 359 aa24.08■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 CAPN2P17655 700 aa24.08■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 CYP2B6P20813 491 aa24.08■■□□□ 1.45
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IMP4-209ENST00000462357 WTAPQ15007 396 aa24.08■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 CPXCR1Q8N123 301 aa24.08■■□□□ 1.45
IMP4-209ENST00000462357 PEX10O60683 326 aa24.07■■□□□ 1.44
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IMP4-209ENST00000462357 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.07■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 MORN1Q5T089 497 aa24.07■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
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IMP4-209ENST00000462357 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.07■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 ZNF333Q96JL9 665 aa24.07■■□□□ 1.44
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IMP4-209ENST00000462357 APBA2Q99767 749 aa24.07■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 HMGCRP04035 888 aa24.06■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
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IMP4-209ENST00000462357 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.06■■□□□ 1.44
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IMP4-209ENST00000462357 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.06■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 CHST13Q8NET6 341 aa24.06■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.06■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.06■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.06■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 SNHG28P0DPA3 235 aa24.05■■□□□ 1.44
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IMP4-209ENST00000462357 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.05■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 MMP19Q99542 508 aa24.05■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.05■■□□□ 1.44
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IMP4-209ENST00000462357 REPS2Q8NFH8 660 aa24.04■■□□□ 1.44
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IMP4-209ENST00000462357 ADORA2AP29274 412 aa24.03■■□□□ 1.44
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IMP4-209ENST00000462357 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.03■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.03■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 USP6NLQ92738 828 aa24.03■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 CCDC69A6NI79 296 aa24.02■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 PRC1O43663 620 aa24.02■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 INHAP05111 366 aa24.02■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 ELNP15502 786 aa24.02■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 PSMA5P28066 241 aa24.02■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 TRAF1Q13077 416 aa24.02■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.02■■□□□ 1.44
IMP4-209ENST00000462357 RNF208Q9H0X6 261 aa24.02■■□□□ 1.44
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IMP4-209ENST00000462357 CALM2P0DP24 149 aa24.01■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 CALM3P0DP25 149 aa24.01■■□□□ 1.43
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IMP4-209ENST00000462357 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.01■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 ACAD9Q9H845 621 aa24.01■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
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IMP4-209ENST00000462357 ICAM1P05362 532 aa24■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 CCDC174Q6PII3 467 aa24■■□□□ 1.43
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IMP4-209ENST00000462357 CHST3Q7LGC8 479 aa24■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 CCPG1Q9ULG6 757 aa24■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 CCL5P13501 91 aa23.99■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 HSPA4P34932 840 aa23.99■■□□□ 1.43
IMP4-209ENST00000462357 LIFRP42702 1097 aa23.99■■□□□ 1.43
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