RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 IGFBP4P22692 258 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 CYP2C19P33261 490 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 PHKA1P46020 1223 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 TLE2Q04725 743 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 MVPQ14764 893 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 TRIM60Q495X7 471 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 RNF180Q86T96 592 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 FEZ1Q99689 392 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 USP44Q9H0E7 712 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.3□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.3□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 A0A1B0GUL6 1792 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 MYH2Q9UKX2 1941 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 SEPT4O43236 478 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 PEX10O60683 326 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 HLA-DOAP06340 250 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 FDX1P10109 184 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 RARBP10826 455 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 RHBDL3P58872 404 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 TIMM10P62072 90 aa6.29□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 HLA-CQ95604 372 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 CABP5Q9NP86 173 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.29□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 PTPRCP08575 1304 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 DOCK1Q14185 1865 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 KIAA0355O15063 1070 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 RASGRF1Q13972 1273 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 GRB14Q14449 540 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 COG2Q14746 738 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 SNX17Q15036 470 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 LRRC41Q15345 812 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 RAB30Q15771 203 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 XAGE2Q96GT9 111 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.28□□□□□ -1.4
CBX1-204ENST00000444685 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.28□□□□□ -1.4
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CBX1-204ENST00000444685 TMEM199Q8N511 208 aa6.27□□□□□ -1.41
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CBX1-204ENST00000444685 USP38Q8NB14 1042 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-204ENST00000444685 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-204ENST00000444685 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CBX1-204ENST00000444685 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CBX1-204ENST00000444685 TOX2Q96NM4 488 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-204ENST00000444685 MROH8Q9H579 483 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-204ENST00000444685 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-204ENST00000444685 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
CBX1-204ENST00000444685 NRBP1Q9UHY1 535 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-204ENST00000444685 PALD1Q9ULE6 856 aa6.27□□□□□ -1.41
CBX1-204ENST00000444685 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.27□□□□□ -1.41
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