RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 TTLL3Q9Y4R7 772 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 NDUFAB1O14561 156 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 DAPK3O43293 454 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 ARID5BQ14865 1188 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 JDP2Q8WYK2 163 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 STAMQ92783 540 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 TRIM31Q9BZY9 425 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 ZAP70P43403 619 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 DAB2P98082 770 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 NECTIN1Q15223 517 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 JAKMIP2Q96AA8 810 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 FNBP1Q96RU3 617 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 ARMT1Q9H993 441 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 ADD1P35611 737 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 CD2APQ9Y5K6 639 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 V9GY48 417 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 PREX2Q70Z35 1606 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 HSPA1LP34931 641 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 NOD1Q9Y239 953 aa12.75□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 NOL3O60936 208 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 HS2ST1Q7LGA3 356 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 KSR1Q8IVT5 923 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 NYXQ9GZU5 481 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 GNPATO15228 680 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 INPP5BP32019 993 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 C16orf87Q6PH81 154 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 TSGA10Q9BZW7 698 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 MTUS1Q9ULD2 1270 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 ATP7BP35670 1465 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 NCAPH2Q6IBW4 605 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 CLIC6Q96NY7 704 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 GAS8O95995 478 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 KRT20P35900 424 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 GIPC2Q8TF65 315 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 SLC52A2Q9HAB3 445 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 FBXL5Q9UKA1 691 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 IQGAP3Q86VI3 1631 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 TRAF5O00463 557 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 TMOD1P28289 359 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 GOLGA8FQ08AF8 430 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 WDR44Q5JSH3 913 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 CXorf56Q9H5V9 222 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 TBX22Q9Y458 520 aa12.74□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 RESTQ13127 1097 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 CEP85LQ5SZL2 805 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 C8orf74Q6P047 294 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 SPOPO43791 374 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 EPB41P11171 864 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 PALM2Q8IXS6 379 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 STX10O60499 249 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 CLCN6P51797 869 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 CTDSPL2Q05D32 466 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 TCP10Q12799 353 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 PTPN21Q16825 1174 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 PROSER3Q2NL68 480 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 TTC38Q5R3I4 469 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 ANO3Q9BYT9 981 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 UFL1O94874 794 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 POLA2Q14181 598 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 RABGGTAQ92696 567 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 PSMB7Q99436 277 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 STMND1H3BQB6 276 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 ITGA6P23229 1130 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 SV2BQ7L1I2 683 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 NOSTRINQ8IVI9 506 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 STMN2Q93045 179 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 CAPN10Q9HC96 672 aa12.73□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 DDIT3P35638 169 aa12.72□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 TRAF1Q13077 416 aa12.72□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 EP400NLQ6ZTU2 488 aa12.72□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CCBE1-202ENST00000439986 CCSER2Q9H7U1 834 aa12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms