RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439822.6

PLEKHB2-208, Transcript of pleckstrin homology domain containing B2, human

TSL 3 BASIC

Gene PLEKHB2, Length 4,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLEKHB2-208	ENST00000439822	DEF6	Q9H4E7	631 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SLFN14	P0C7P3	912 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ICA1	Q05084	483 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CFB	P00751	764 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CPXCR1	Q8N123	301 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TIGD1	Q96MW7	591 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TTLL1	O95922	423 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SP8	Q8IXZ3	490 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FBXL16	Q8N461	479 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RMND1	Q9NWS8	449 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ECE2	O60344	883 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.35	□□□□□ -0.27	4e-6	■■■■□ 21.6
PLEKHB2-208	ENST00000439822	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PAK1	Q13153	545 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SLFN13	Q68D06	897 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SEPT2	Q15019	361 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CUL5	Q93034	780 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	KIFC2	Q96AC6	838 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZSCAN12	O43309	604 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	OR52Z1	P0C646	297 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	AMPD3	Q01432	767 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	DLGAP5	Q15398	846 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SAMM50	Q9Y512	469 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TEX35	Q5T0J7	233 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	EP400	Q96L91	3159 aa		13.33	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		13.33	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	POTEM	A6NI47	508 aa		13.33	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ZBTB7A	O95365	584 aa		13.33	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ARID5A	Q03989	594 aa		13.33	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		13.33	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		13.33	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		13.33	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.33	□□□□□ -0.27
PLEKHB2-208	ENST00000439822	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	GRM4	Q14833	912 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	TAF1	P21675	1872 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	MYO1B	O43795	1136 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	GH2	P01242	217 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SRGN	P10124	158 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PLS1	Q14651	629 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	SV2B	Q7L1I2	683 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PLEKHB2-208	ENST00000439822	KIAA1328	Q86T90	577 aa		13.33	□□□□□ -0.28

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