RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428962.2

THBS3-202, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 2

Gene THBS3, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-202ENST00000428962 TMX1Q9H3N1 280 aa15.52■□□□□ 0.07
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THBS3-202ENST00000428962 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.5■□□□□ 0.07
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THBS3-202ENST00000428962 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15.5■□□□□ 0.07
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THBS3-202ENST00000428962 SLC35G1Q2M3R5 365 aa15.49■□□□□ 0.07
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THBS3-202ENST00000428962 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
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THBS3-202ENST00000428962 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa15.48■□□□□ 0.07
THBS3-202ENST00000428962 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.48■□□□□ 0.07
THBS3-202ENST00000428962 MYO3BQ8WXR4 1341 aa15.48■□□□□ 0.07
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THBS3-202ENST00000428962 GOLGA8HP0CJ92 632 aa15.47■□□□□ 0.07
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THBS3-202ENST00000428962 CD44P16070 742 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
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THBS3-202ENST00000428962 CASP1P29466 404 aa15.47■□□□□ 0.07
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THBS3-202ENST00000428962 ASPRV1Q53RT3 343 aa15.47■□□□□ 0.07
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THBS3-202ENST00000428962 HOMER1Q86YM7 354 aa15.47■□□□□ 0.07
THBS3-202ENST00000428962 CUEDC2Q9H467 287 aa15.47■□□□□ 0.07
THBS3-202ENST00000428962 SPON1Q9HCB6 807 aa15.47■□□□□ 0.07
THBS3-202ENST00000428962 SWAP70Q9UH65 585 aa15.47■□□□□ 0.07
THBS3-202ENST00000428962 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa15.46■□□□□ 0.07
THBS3-202ENST00000428962 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
THBS3-202ENST00000428962 ALDH1B1P30837 517 aa15.46■□□□□ 0.07
THBS3-202ENST00000428962 UBA7P41226 1012 aa15.46■□□□□ 0.07
THBS3-202ENST00000428962 PDCL2Q8N4E4 241 aa15.46■□□□□ 0.07
THBS3-202ENST00000428962 BLZF1Q9H2G9 400 aa15.46■□□□□ 0.07
THBS3-202ENST00000428962 SMCO2A6NFE2 343 aa15.45■□□□□ 0.06
THBS3-202ENST00000428962 OR52Z1P0C646 297 aa15.45■□□□□ 0.06
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