RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 SLF1Q9BQI6 1058 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 NYAP2Q9P242 653 aa15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 A0A1W2PQY0 241 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 MINDY4BA8MYZ0 360 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 GIMAP6Q6P9H5 292 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 APPBP2Q92624 585 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 SLC5A4Q9NY91 659 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 NRBP1Q9UHY1 535 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 TACC3Q9Y6A5 838 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 CHD9Q3L8U1 2897 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 RARBP10826 455 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 KCTD2Q14681 263 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 RASGRP2Q7LDG7 609 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 AMOTL1Q8IY63 956 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 PI4K2BQ8TCG2 481 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 CEP95Q96GE4 821 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 TEX13BQ9BXU2 312 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 ATP2A1O14983 1001 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 KLHDC9Q8NEP7 349 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 MKL1Q969V6 931 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CNGA3-202ENST00000393503 PTGS1P23219 599 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 CPXCR1Q8N123 301 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 KATNBL1Q9H079 304 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 MKNK2Q9HBH9 465 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 INCENPQ9NQS7 918 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 PLIN4Q96Q06 1357 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 MYH4Q9Y623 1939 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 KIAA0355O15063 1070 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 CTAGE5O15320 804 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 CLTBP09497 229 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 AKR1A1P14550 325 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 FAAP100Q0VG06 881 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 IFNL3Q8IZI9 196 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 CHMP4CQ96CF2 233 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 SEMA6BQ9H3T3 888 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 ASTN1O14525 1302 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 MCM3APO60318 1980 aa15.87■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 SLC4A3P48751 1232 aa15.87■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 TDO2P48775 406 aa15.87■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 ACLYP53396 1101 aa15.87■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.87■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 RNF180Q86T96 592 aa15.87■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 KIFC2Q96AC6 838 aa15.87■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF536O15090 1300 aa15.87■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 SALL3Q9BXA9 1300 aa15.87■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 COPB2P35606 906 aa15.86■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 CNTN2Q02246 1040 aa15.86■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 KCNA10Q16322 511 aa15.86■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa15.86■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa15.86■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa15.86■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 NEDD1Q8NHV4 660 aa15.86■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 CNPY2Q9Y2B0 182 aa15.86■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 TTC28Q96AY4 2481 aa15.86■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 NMT2O60551 498 aa15.85■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 SNAP25P60880 206 aa15.85■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 ACVR2BQ13705 512 aa15.85■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM63BQ5T3F8 832 aa15.85■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.85■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 SLFN13Q68D06 897 aa15.85■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.85■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.85■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 TBX21Q9UL17 535 aa15.85■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
CNGA3-202ENST00000393503 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms