RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.68□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.68□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.68□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SSH3Q8TE77 659 aa7.68□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CEP89Q96ST8 783 aa7.68□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TJP1Q07157 1748 aa7.68□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CNGA1P29973 690 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IDH3AP50213 366 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FCGRTP55899 365 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM32Q13049 653 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MTERF2Q49AM1 385 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SEZ6Q53EL9 994 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STK32BQ9NY57 414 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOXO4P98177 505 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CENPCQ03188 943 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PWP1Q13610 501 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UTYO14607 1347 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RREB1Q92766 1687 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSPAN6O43657 245 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDE8AO60658 829 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GJB6O95452 261 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ITGA6P23229 1130 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CASP7P55210 303 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 JMYQ8N9B5 988 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDK15Q96Q40 435 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GREM2Q9H772 168 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CNNM1Q9NRU3 951 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CTSWP56202 376 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NFIXQ14938 502 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NYXQ9GZU5 481 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PNMA2Q9UL42 364 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NTSR2O95665 410 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GYS1P13807 737 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LIG3P49916 1009 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLN3Q13286 438 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRRC24Q50LG9 513 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CNBD1Q8NA66 436 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIF1BPQ96EK5 621 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MPHOSPH8Q99549 860 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GIPRP48546 466 aa7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TFCP2Q12800 502 aa7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC15A2Q16348 729 aa7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TNNI3KQ59H18 835 aa7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AACSQ86V21 672 aa7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NKD1Q969G9 470 aa7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NLRP3Q96P20 1036 aa7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C4BP0C0L5 1744 aa7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SCGB1D2O95969 90 aa7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SERPINB2P05120 415 aa7.64□□□□□ -1.19
TRAPPC3L-201ENST00000356128 INPP5BP32019 993 aa7.64□□□□□ -1.19
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