RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 DaglaQ6WQJ1 1044 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Epha10Q8BYG9 1007 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ildr1Q8CBR1 537 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Phldb2Q8K1N2 1249 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Txndc5Q91W90 417 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mss51Q9D5Z5 446 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tube1Q9D6T1 475 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Akap8Q9DBR0 687 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Copb1Q9JIF7 953 aa20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Uso1Q9Z1Z0 959 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krt18P05784 423 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Alppl2P24823 529 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdan1Q8CC12 1239 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arhgef6Q8K4I3 771 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tfap4Q9JIZ5 338 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pabpc1lA2A5N3 607 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slurp2P0DP59 97 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NefhP19246 1090 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Stim1P70302 685 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cbx1P83917 185 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam178bQ24JP3 464 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ovgp1Q62010 721 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kctd3Q8BFX3 815 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tada3Q8R0L9 432 aa20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kif23E9Q5G3 953 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gng11P61953 73 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tango6Q8C3S2 1079 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q8C5C9 218 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ushbp1Q8R370 680 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Syce1Q9D495 329 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm5114W4VSN8 858 aa20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem132bF7BAB2 1078 aa20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mboat4P0C7A3 435 aa20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Traf1P39428 409 aa20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Uri1Q3TLD5 531 aa20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mdh1bQ5F204 500 aa20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trak2Q6P9N8 913 aa20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Iqcb1Q8BP00 598 aa20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vps18Q8R307 973 aa20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rbm19Q8R3C6 952 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 BaatQ91X34 420 aa20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Efhd1Q9D4J1 240 aa20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trmt112Q9DCG9 125 aa20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ly75Q60767 1723 aa20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Scn9aQ62205 1984 aa20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Grem2O88273 168 aa20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcna1P16388 495 aa20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lamb3Q61087 1168 aa20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ParnQ8VDG3 624 aa20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp1r3gQ9CW07 347 aa20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sel1lQ9Z2G6 790 aa20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcsk7Q61139 770 aa20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ces3aQ63880 571 aa20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tubb2aQ7TMM9 445 aa20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ces3bQ8VCU1 571 aa20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Xrcc4Q924T3 326 aa20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tubb2bQ9CWF2 445 aa20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Akt1s1Q9D1F4 257 aa20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pkd2l2Q9JLG4 621 aa20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bpifb4A2BGH0 617 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pip4k2aO70172 405 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prpf40bQ80W14 870 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Maats1Q8BRC6 783 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cabp7Q91ZM8 215 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Snrnp35Q9D384 244 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pex3Q9QXY9 372 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tnni3kQ5GIG6 834 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccna1Q61456 421 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mtss1lQ6P9S0 715 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Txndc16Q7TN22 820 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Necab1Q8BG18 352 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rassf4Q8CB96 322 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem63cQ8CBX0 802 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rab3il1Q8VDV3 383 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Egfl6Q9JJZ5 550 aa20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc39a2G3X943 309 aa20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rad23aP54726 363 aa20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GnptabQ69ZN6 1235 aa20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Setdb2Q8C267 713 aa20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tesk2Q8VCT9 570 aa20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Desi2Q9D291 194 aa20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc26a4Q9R155 780 aa20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GsdmeQ9Z2D3 512 aa20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rsph10bE9PYQ0 876 aa20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rasa3Q60790 834 aa20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hspa4Q61316 841 aa20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc172Q810N9 267 aa20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 LarsQ8BMJ2 1178 aa20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trub2Q91WG3 331 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mtmr4Q91XS1 1190 aa20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 4930548H24RikQ9D496 437 aa20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ces1aE9PYP1 563 aa20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ano9P86044 747 aa20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Emc10Q3TAS6 258 aa20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Scnn1aQ61180 699 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.2 ms