RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023363.6

Rrn3-201, Transcript of RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rrn3, Length 3,597 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3-201ENSMUST00000023363 DSCC1Q14AI0 399 aa10.96□□□□□ -0.65
Rrn3-201ENSMUST00000023363 SowahdQ8BY98 327 aa10.96□□□□□ -0.65
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Tada3Q8R0L9 432 aa10.96□□□□□ -0.65
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Bap1Q99PU7 728 aa10.96□□□□□ -0.65
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Igsf9bE9PZ19 1328 aa10.96□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Tbc1d2B1AVH7 922 aa10.96□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Glra4Q61603 456 aa10.96□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Mfap3Q922T2 349 aa10.96□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Thap2Q9D305 217 aa10.96□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Klhl40Q9D783 621 aa10.96□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Wnt7aP24383 349 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ptpn12P35831 775 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Abcd1P48410 736 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Tdo2P48776 406 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Hoxa13Q62424 386 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Rbm12b2Q66JV4 834 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ctdp1Q7TSG2 960 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Apol10aQ8CCA5 318 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Xrcc4Q924T3 326 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 LpxnQ99N69 386 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Mis18aQ9CZJ6 204 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Arap2Q8BZ05 1703 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Slc2a13Q3UHK1 637 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Asic1Q6NXK8 526 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Strip1Q8C079 837 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Q8CEZ4 452 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Spire2Q8K1S6 718 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cdk8Q8R3L8 464 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Pcdha12Q91Y18 950 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ccnt1Q9QWV9 724 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Sh3bp1P55194 680 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 ItpripQ3TNL8 555 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 AmfrQ9R049 643 aa10.95□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 4932429P05RikA2ADI4 785 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ftl1P29391 183 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Lrp6O88572 1613 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Gm7356A0A087WSA6 508 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 DohhA0A1Y7VJ29 135 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Pak1O88643 545 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Kcna1P16388 495 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Gucy2cQ3UWA6 1072 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Hdac4Q6NZM9 1076 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ulbp1Q8HWA3 334 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Tbc1d23Q8K0F1 684 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Taf6lQ8R2K4 616 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 MlphQ91V27 590 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Tmem47Q9JJG6 181 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Egfl6Q9JJZ5 550 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ubxn8Q9QZ49 277 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Atp1a4Q9WV27 1032 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa10.94□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Csf1rP09581 977 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ric8aQ3TIR3 530 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Gga3Q8BMI3 718 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 LarsQ8BMJ2 1178 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 NelfbQ8C4Y3 580 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Lrrc41Q8K1C9 807 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Myo1hQ9D6A1 958 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Lonp2Q9DBN5 852 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Pex3Q9QXY9 372 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cul4bA2A432 970 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Atp6v0a2P15920 856 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Rad23aP54726 363 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Map9Q3TRR0 646 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Plekha7Q3UIL6 1118 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Nlrp2Q4PLS0 1046 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Q66JV7 365 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Jade2Q6ZQF7 829 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Jag1Q9QXX0 1218 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Prkab1Q9R078 270 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Mrvi1Q9WUX5 899 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Klrk1O54709 232 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Irx2P81066 474 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Rtkn2Q14B46 604 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Meis1Q60954 390 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Fez2Q6TYB5 348 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Lrrc15Q80X72 579 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 NapaQ9DB05 295 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Nr2e3Q9QXZ7 395 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Slfn1Q9Z0I7 337 aa10.93□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Psd3Q2PFD7 1037 aa10.92□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cep112Q5PR68 954 aa10.92□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Gpbp1Q6NXH3 473 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Fermt2Q8CIB5 680 aa10.92□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Tcp11l2Q8K1H7 517 aa10.92□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Mfap3lQ9D3X9 409 aa10.92□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Copb1Q9JIF7 953 aa10.92□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Itga2bQ9QUM0 1033 aa10.92□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Uso1Q9Z1Z0 959 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Shank3Q4ACU6 1730 aa10.92□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa10.92□□□□□ -0.66
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Lama4P97927 1816 aa10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.5 ms