RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Enox1Q8BHR2 643 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppp2r5dQ91V89 594 aa22.4■■□□□ 1.18
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tab2Q99K90 693 aa22.4■■□□□ 1.18
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ttc5Q99LG4 440 aa22.4■■□□□ 1.18
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa22.4■■□□□ 1.18
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa22.4■■□□□ 1.18
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr247E9PVJ7 320 aa22.4■■□□□ 1.18
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr819K7N727 320 aa22.4■■□□□ 1.18
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ugt1a6bK9J7B2 531 aa22.4■■□□□ 1.18
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tpm2P58774 284 aa22.4■■□□□ 1.18
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ugt1a6Q64435 531 aa22.4■■□□□ 1.18
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gpbp1Q6NXH3 473 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ugt1a7cQ6ZQM8 531 aa22.4■■□□□ 1.18
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tjap1Q9DCD5 539 aa22.4■■□□□ 1.18
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dnai2A2AC93 623 aa22.39■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tdo2P48776 406 aa22.39■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Asnsd1Q8BFS9 627 aa22.39■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa22.39■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Krt78E9Q0F0 1068 aa22.38■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Oxr1Q4KMM3 866 aa22.38■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PsdQ5DTT2 1024 aa22.38■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc10a5Q5PT54 434 aa22.38■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Brip1Q5SXJ3 1174 aa22.38■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GapdhsQ64467 440 aa22.38■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cd248Q91V98 765 aa22.38■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Col1a1P11087 1453 aa22.38■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cul4bA2A432 970 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Copb2O55029 905 aa22.38■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tigd5Q499M4 642 aa22.38■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa22.38■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa22.38■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Klhl30Q8C3F7 581 aa22.38■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pex3Q9QXY9 372 aa22.38■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Itgb4A2A863 1818 aa22.37■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AdpgkQ8VDL4 496 aa22.37■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nlrp5Q9R1M5 1163 aa22.37■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cfap70D3YVL2 1141 aa22.37■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gse1Q3U3C9 1213 aa22.37■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PaoxQ8C0L6 504 aa22.37■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa22.37■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kctd10Q922M3 315 aa22.37■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Krtap5-3Q9D226 196 aa22.37■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nr1i2O54915 431 aa22.36■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mx1P09922 631 aa22.36■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adssl1P28650 457 aa22.36■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cnga2Q62398 664 aa22.36■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Taf6lQ8R2K4 616 aa22.36■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nme9A0A1L1SUL6 329 aa22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sept2P42208 361 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mybl2P48972 704 aa22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eif5P59325 429 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Npr3P70180 536 aa22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RragbQ6NTA4 374 aa22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mtss1lQ6P9S0 715 aa22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fermt2Q8CIB5 680 aa22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mical1Q8VDP3 1048 aa22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trub2Q91WG3 331 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem191cQ9JJB1 302 aa22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc27a3O88561 667 aa22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Anks1aP59672 1150 aa22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gpatch11Q3UFS4 262 aa22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CbarpQ66L44 698 aa22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sval3Q76I99 144 aa22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Snrnp35Q9D384 244 aa22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Klf15Q9EPW2 415 aa22.35■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdkn1cP49919 348 aa22.34■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdc37Q61081 379 aa22.34■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccna1Q61456 421 aa22.34■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cep135Q6P5D4 1140 aa22.34■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa22.34■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q91WD4 421 aa22.34■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cd274Q9EP73 290 aa22.34■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Col2a1P28481 1487 aa22.34■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Akr1c19G3X9Y6 323 aa22.34■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ncf1Q09014 390 aa22.34■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Qrich1Q3UA37 777 aa22.34■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psg29Q3URN6 468 aa22.34■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp2c67Q569X9 491 aa22.34■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adck2Q6NSR3 617 aa22.34■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PigsQ6PD26 555 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Serpina10Q8R121 448 aa22.34■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Akap4Q60662 849 aa22.33■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GlyctkQ8QZY2 523 aa22.33■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Krt82Q99M74 516 aa22.33■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Arl6ip4Q9JM93 229 aa22.33■■□□□ 1.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Apol7aB2RT54 418 aa22.32■■□□□ 1.16
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CnpP16330 420 aa22.32■■□□□ 1.16
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rasa2P58069 847 aa22.32■■□□□ 1.16
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ift88Q61371 824 aa22.32■■□□□ 1.16
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Aggf1Q7TN31 711 aa22.32■■□□□ 1.16
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc172Q810N9 267 aa22.32■■□□□ 1.16
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Armc6Q8BNU0 468 aa22.32■■□□□ 1.16
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ildr1Q8CBR1 537 aa22.32■■□□□ 1.16
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cabp7Q91ZM8 215 aa22.32■■□□□ 1.16
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Thap2Q9D305 217 aa22.32■■□□□ 1.16
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf568E9PYI1 671 aa22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.3 ms