RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A YOR378WQ08902 515 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A TCO89Q08921 799 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YPL199CQ08954 240 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A COX17Q12287 69 aa0.49□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A BAR1P12630 587 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A PET123P17558 318 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SPO7P18410 259 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ERG1P32476 496 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A NDC1P32500 655 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A TFC4P33339 1025 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A PHD1P36093 366 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A UTH1P36135 365 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ESL2P36168 1195 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A NAT2P37293 288 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ARO9P38840 513 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SEC31P38968 1273 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A PCL6P40038 420 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A DJP1P40564 432 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A DIM1P41819 318 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A RPS7BP48164 190 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ARK1P53974 638 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A RCR2Q03446 210 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A BUD22Q04347 519 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A CRN1Q06440 651 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A REX4Q08237 289 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A CLB4P24871 460 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SEC9P40357 651 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A TDA10P42938 290 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YJL107CP42947 387 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A HAL1Q01766 294 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A EKI1Q03764 534 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YMR230W-AQ3E7B5 62 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YCP4P25349 247 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SNT1P25357 1226 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YKL133CP36066 463 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A CHK1P38147 527 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SDT1P53078 280 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A PEX14P53112 341 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A HMO1Q03973 246 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YLL056CQ12177 298 aa0.48□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A CHO2P05374 869 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SPO16P17122 198 aa0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A PAP1P29468 568 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A PFK26P40433 827 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SMK1P41808 388 aa0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ALT2P52892 507 aa0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A GOR1P53839 350 aa0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A SHR3Q02774 210 aa0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YPR091CQ06833 770 aa0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A LSP1Q12230 341 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A LCB4Q12246 624 aa0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YBR085C-AO43137 85 aa0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A RPI1P23250 407 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A CMK1P27466 446 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A DAL3P32459 195 aa0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A RML2P32611 393 aa0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A MID2P36027 376 aa0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A CRH1P53301 507 aa0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A KTR6P54070 446 aa0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A TRS31Q03337 283 aa0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A TMA64Q04600 565 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
YPL060C-AYPL060C-A YRF1-3P0CX14 1859 aa0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YRF1-7P0CX15 1859 aa0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YRF1-6P53819 1859 aa0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A CBF2P32504 956 aa0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A ACS1Q01574 713 aa0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A IVY1Q04934 453 aa0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A PBA1Q05778 276 aa0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A DNF2Q12675 1612 aa0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A NAT1P12945 854 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A IST1P53843 298 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YRF1-2P40105 1681 aa0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A SSM4P40318 1319 aa0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A MTC6P38849 526 aa0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A SSP120P39931 234 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A RPT2P40327 437 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YPI1P43587 155 aa0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A ALG12P53730 551 aa0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A GIP3Q03016 1276 aa0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A DPB4Q04603 196 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A NBP2Q12163 236 aa0.46□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A ASP3-2P0CX77 362 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A ASP3-3P0CX78 362 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A ASP3-4P0CX79 362 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YER190C-BP0CX94 160 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YEL077W-AP0CX95 160 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YGR296C-BP0CX96 160 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YPL283W-BP0CX97 160 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A YPR204C-AP0CX98 160 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A ASP3-1P0CZ17 362 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A APM3P38153 483 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A AVT5P38176 459 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A UBS1P38290 277 aa0.45□□□□□ -2.34
YPL060C-AYPL060C-A ARP1P38696 384 aa0.45□□□□□ -2.34
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