RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	SPE1	P08432	466 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	URK1	P27515	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	URA10	P30402	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	GCS1	P35197	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	KTR4	P38131	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	DUG2	P38149	878 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	ATG12	P38316	186 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	YBR225W	P38321	900 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	YHL041W	P38730	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	RIM4	P38741	713 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	SFB3	P38810	929 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	DSN1	P40568	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	YFL054C	P43549	646 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	BST1	P43571	1029 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	ZIP2	P53061	704 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	YGR053C	P53234	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	YGR127W	P53275	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	YPR003C	P53394	754 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	EFM6	P53970	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	NRT1	Q08485	598 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	RRD2	Q12461	358 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TRM10	YOL093W	GPA2	P10823	449 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	CMP2	P14747	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	GPI10	P30777	616 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	MRPL40	P36534	297 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	MSR1	P38714	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	CIN4	P39110	191 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	STL1	P39932	569 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YEL028W	P39989	153 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	MOB1	P40484	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	RRT5	P43607	289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	URB2	P47108	1174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	MRX6	P48564	524 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YNL034W	P53963	612 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YNL018C	P53976	612 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	INA17	Q02888	182 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	ROT1	Q03691	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	PGC1	Q08959	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	AVL9	Q12500	764 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	PEX1	P24004	1043 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	PEX34	P25584	144 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	ADY2	P25613	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	PEX2	P32800	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	DOM34	P33309	386 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	STB5	P38699	743 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SMF2	P38778	549 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	UBP7	P40453	1071 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	MAF1	P41910	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YGL176C	P46945	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SAE2	P46946	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	CWC24	P53769	259 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
TRM10	YOL093W	MET14	Q02196	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	ARA2	Q04212	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	TMA10	Q06177	86 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	LDB18	Q07887	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	PIN2	Q12057	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	AFI1	Q99222	893 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	HEM15	P16622	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	OAF3	P36023	863 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	PPE1	P38796	400 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	ERR3	P42222	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TRM10	YOL093W	GYP8	P43570	497 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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