RNA–Protein interactions for RNA: YNL108C

YNL108C, Transcript of Protein phosphatase, yeast

Gene YNL108C, Length 813 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL108C	YNL108C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	YNL146W	P53906	100 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	AQR1	P53943	586 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	ORC4	P54791	529 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	MEC3	Q02574	474 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	PPM1	Q04081	328 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	RCO1	Q04779	684 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	VPS38	Q05919	439 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	ATG23	Q06671	453 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	RTC1	Q08281	1341 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	YRF1-4	O13559	1382 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.68	□□□□□ -1.5	not detected
YNL108C	YNL108C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	CBS1	P14066	229 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	CDC42	P19073	191 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	PER1	P25625	357 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	AFG1	P32317	509 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	CYM1	P32898	989 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	REC104	P33323	182 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	IFA38	P38286	347 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	YMR262W	P38430	313 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	JHD1	P40034	492 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	ASG1	P40467	964 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	MET28	P40573	187 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	KAP114	P53067	1004 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	DSD1	P53095	428 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	DIP5	P53388	608 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	PET117	Q02771	107 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	SPO19	Q03029	223 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	BNA7	Q04066	261 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	SKG3	Q06315	1026 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	FMP45	Q07651	309 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	DCI1	Q08558	271 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	GET4	Q12125	312 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	UBX3	Q12229	455 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	YDR061W	Q12298	539 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	SPE2	P21182	396 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	UTR1	P21373	530 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	SEC65	P29478	273 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	NUF2	P33895	451 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	MUP3	P38734	546 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	YHR182W	P38870	785 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	RGI2	P40188	164 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	IMA1	P53051	589 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	PEX13	P80667	386 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	KAP120	Q02932	1032 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	YMR210W	Q03649	449 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	CSI1	Q04368	295 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	ARG7	Q04728	441 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	OMS1	Q06668	471 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	YFH1	Q07540	174 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	GSH2	Q08220	491 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	MET7	Q08645	548 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	SRO7	Q12038	1033 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	DFG16	Q99234	619 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.66	□□□□□ -1.5	RIP-Chip
YNL108C	YNL108C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	RAD7	P06779	565 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	SYN8	P31377	255 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	NUP133	P36161	1157 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	CEP3	P40969	608 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	YFR018C	P43599	363 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	EFM3	P47163	339 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	GTO1	P48239	356 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	YGL242C	P53066	181 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	YGL138C	P53122	345 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	YNL181W	P53878	407 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	ARP4	P80428	489 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	YSA1	Q01976	231 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YNL108C	YNL108C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.7 ms