RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	JIP4	Q03361	876 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	TAF11	Q04226	346 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	KAR5	Q04746	504 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	PDR8	Q06149	701 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	ATP14	Q12349	124 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	DGK1	Q12382	290 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YPR1	Q12458	312 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RRD2	Q12461	358 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	FOB1	O13329	566 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CYB2	P00175	591 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	BI2	P03873	423 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MIP1	P15801	1254 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RAM1	P22007	431 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MRPL8	P22353	238 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SPT14	P32363	452 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RRN6	P32786	894 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	DCW1	P36091	449 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YBR137W	P38276	179 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PSY2	P40164	858 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	AGP3	P43548	558 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ROG3	P43602	733 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	BNA6	P43619	295 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	HOC1	P47124	396 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YGR153W	P48238	217 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	VHS1	Q03785	461 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PHM6	Q05637	104 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SPO77	Q06134	477 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CRN1	Q06440	651 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YEH1	Q07804	573 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RIT1	P23796	513 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	POP4	P38336	279 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	BSD2	P38356	321 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	OCA5	P38738	679 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SMF2	P38778	549 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YMR134W	P40207	237 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SAP4	P53036	818 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	TPN1	P53099	579 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SLI1	P53304	468 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PFA5	Q03289	374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RNH1	Q04740	348 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CDC73	Q06697	393 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YOL107W	Q12239	342 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	LAG2	Q92325	660 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MED11	Q99278	115 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	TPK3	P05986	398 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RAD18	P10862	487 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PTP1	P25044	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RAD27	P26793	382 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	THI4	P32318	326 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RRN3	P36070	627 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PET10	P36139	283 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CTP1	P38152	299 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MAL31	P38156	614 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	GIC1	P38785	314 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	LNP1	P38878	278 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PLB1	P39105	664 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ASG1	P40467	964 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CHS6	P40955	746 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MNN5	P46982	586 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	IRC18	P47056	224 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	NIT3	P49954	291 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	GET1	P53192	235 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	UBP16	Q02863	499 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	NHP10	Q03435	203 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MRX10	Q05648	414 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	BUR2	Q05949	395 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MHR1	Q06630	226 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	REH1	Q06709	432 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SSP2	Q08646	371 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	GPM3	Q12326	303 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SET6	Q12529	373 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MGT1	P26188	188 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CIN8	P27895	1000 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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