RNA–Protein interactions for RNA: YJR136C

TTI2, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI2, Length 1,266 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI2	YJR136C	YEH1	Q07804	573 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	PCL8	Q08966	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	KAR3	P17119	729 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	SPE2	P21182	396 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	YSP3	P25036	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	PTC6	P25646	442 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	HOT13	P36078	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	EXO1	P39875	702 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	SWP82	P43554	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	TAX4	P47030	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	SMC3	P47037	1230 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	SEG1	Q04279	960 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	HRD3	Q05787	833 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	THI7	Q05998	598 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	PCT1	P13259	424 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	ROX1	P25042	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	POL4	P25615	582 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	UBP11	P36026	717 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	AFG3	P39925	761 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	ECM10	P39987	644 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	FAR3	P46671	204 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	YJL043W	P47053	257 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	DIA3	P52290	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	YGR127W	P53275	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	ORM2	Q06144	216 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	CIR2	Q08822	631 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	ERG11	P10614	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	GSY2	P27472	705 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	BLI1	P35727	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	BYE1	P36106	594 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	BUR6	P40096	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	CYK3	Q07533	885 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	INP53	Q12271	1107 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	RTN2	Q12443	393 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TTI2	YJR136C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	MET17	P06106	444 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	DBF4	P32325	704 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	ERG3	P32353	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	UBP13	P38187	747 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	RKM3	P38222	552 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	LTP1	P40347	161 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	MET28	P40573	187 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	AXL1	P40851	1208 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	THI3	Q07471	609 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	RIM20	Q12033	661 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	AVL9	Q12500	764 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	YPT6	Q99260	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	PDX1	P16451	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	MSS51	P32335	436 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	VID24	P38263	362 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	CTK2	P46962	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	BOP3	P53958	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	ZDS2	P54786	942 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	RIM13	Q03792	727 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	FIN1	Q03898	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	VPS38	Q05919	439 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	APL4	Q12028	832 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	SPE4	Q12455	300 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	APN1	P22936	367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	CLB3	P24870	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	SEF1	P34228	1148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	SRO77	P38163	1010 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	MET18	P40469	1032 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	YML6	P51998	286 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	NNF2	P53253	936 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	BSP1	Q06604	576 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	RAD34	Q06665	692 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TTI2	YJR136C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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