RNA–Protein interactions for RNA: YHL030W

ECM29, Transcript of Scaffold protein, yeast

Gene ECM29, Length 5,607 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM29	YHL030W	PDR3	P33200	976 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SKT5	P34226	696 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YBL086C	P38177	466 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YEN1	P40028	759 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MOG1	P47123	218 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ATF2	P53296	535 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	OSH6	Q02201	448 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SWP1	Q02795	286 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ROD1	Q02805	837 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	BSC2	Q05611	235 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	CDC123	Q05791	360 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RSC2	Q06488	889 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
ECM29	YHL030W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	APC9	Q12107	265 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	STB3	Q12427	513 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YSP3	P25036	478 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	VBA3	P25594	458 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RNP1	P32385	249 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YKR075C	P36155	307 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	VBA5	P36172	582 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YRO2	P38079	344 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MTG2	P38860	518 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ECM10	P39987	644 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ASI2	P53895	289 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SLM2	P53955	656 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RSC9	Q03124	581 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	VHS1	Q03785	461 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YMR155W	Q03795	547 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	GPM3	Q12326	303 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ATP12	P22135	325 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
ECM29	YHL030W	ATG22	P25568	528 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PPZ1	P26570	692 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	LRG1	P35688	1017 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YCR087C-A	P37263	153 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RSC30	P38781	883 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	GPB2	P39717	880 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	AVT2	P39981	480 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YEL028W	P39989	153 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	DDI1	P40087	428 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ASG1	P40467	964 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	LEM3	P42838	414 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TDA1	Q03533	586 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TRM82	Q03774	444 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	BUD7	Q08754	746 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	BBP1	Q12365	385 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	CCP1	P00431	361 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	CIT2	P08679	460 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RAP1	P11938	827 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	GAC1	P28006	793 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	CTF13	P35203	478 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	APT2	P36973	181 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YHR131C	P38835	850 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	MDM31	P38880	579 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	SSO2	P39926	295 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YFR006W	P43590	535 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	BNA6	P43619	295 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	GCV2	P49095	1034 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	DIE2	P50076	525 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TAM41	P53230	385 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YNL033W	P53964	284 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	YNL019C	P53975	284 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	PDR8	Q06149	701 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	RBD2	Q12270	262 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ECM29	YHL030W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97

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