RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 FCER1AP12319 257 aa29.95■■■□□ 2.39
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PTPRF-216ENST00000617451 Q7L0L9 218 aa29.95■■■□□ 2.39
PTPRF-216ENST00000617451 MAML3Q96JK9 1138 aa29.95■■■□□ 2.39
PTPRF-216ENST00000617451 SLC25A27O95847 323 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPRF-216ENST00000617451 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPRF-216ENST00000617451 C20orf194Q5TEA3 1177 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPRF-216ENST00000617451 ANO1Q5XXA6 986 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO28Q9NVF7 368 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPRF-216ENST00000617451 PARP14Q460N5 1801 aa29.94■■■□□ 2.38
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PTPRF-216ENST00000617451 MMP19Q99542 508 aa29.9■■■□□ 2.38
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PTPRF-216ENST00000617451 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa29.89■■■□□ 2.38
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PTPRF-216ENST00000617451 REPS2Q8NFH8 660 aa29.88■■■□□ 2.37
PTPRF-216ENST00000617451 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa29.88■■■□□ 2.37
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PTPRF-216ENST00000617451 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa29.78■■■□□ 2.36
PTPRF-216ENST00000617451 BADQ92934 168 aa29.78■■■□□ 2.36
PTPRF-216ENST00000617451 RIPK3Q9Y572 518 aa29.78■■■□□ 2.36
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