RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.2■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PAGE5Q96GU1 130 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BARHL2Q9NY43 387 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SRGNP10124 158 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A087X0B3 334 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KLRF2D3W0D1 207 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RIMBP2O15034 1052 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CFAP100Q494V2 611 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IQUBQ8NA54 791 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SNED1Q8TER0 1413 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLSCR1O15162 318 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMARCA1P28370 1054 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDE6BP35913 854 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GSDMAQ96QA5 445 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KCND1Q9NSA2 647 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CYTH3O43739 400 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MTMR7Q9Y216 660 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LTBP1Q14766 1721 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 M0R2N6 131 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STXBP3O00186 592 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TNNT1P13805 278 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AFMP43652 599 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TXLNAP40222 546 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NOVP48745 357 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AKT1S1Q96B36 256 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DPYDQ12882 1025 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF827Q17R98 1081 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CEP95Q96GE4 821 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADAMTS3O15072 1205 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KCNJ6P48051 423 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VSTM4Q8IW00 320 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GOLGA8HP0CJ92 632 aa21.14■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF18P17022 549 aa21.14■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DPF2Q92785 391 aa21.14■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 G3V3G9 751 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LAD1O00515 517 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 E2F4Q16254 413 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IL17AQ16552 155 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MASTLQ96GX5 879 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GNA11P29992 359 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 APBA3O96018 575 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NAPAP54920 295 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GABPAQ06546 454 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PICALMQ13492 652 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PTPN14Q15678 1187 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C6orf50Q9HD87 102 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SWAP70Q9UH65 585 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 F8W031 263 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CERS5Q8N5B7 392 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MMP10P09238 476 aa21.11■□□□□ 0.97
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SOGA3Q5TF21 947 aa21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms