RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOPCQ9HD26 462 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 ROBO3Q96MS0 1386 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERC2O15083 957 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 COBLO75128 1261 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 PGK2P07205 417 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 HOXC6P09630 235 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYBAP13498 195 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM132BQ14DG7 1078 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC26Q2I0M4 334 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 MB21D1Q8N884 522 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRO3102Q9H379 93 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTC41PQ6P2S7 1318 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYH4Q9Y623 1939 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 VWA5AO00534 786 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDUFB10O96000 172 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 COL6A1P12109 1028 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 FCER1AP12319 257 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAPN2P17655 700 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 SBK1Q52WX2 424 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM47AQ5JRC9 791 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRCH3Q96II8 777 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 MMP19Q99542 508 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 NAPBQ9H115 298 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 MROH8Q9H579 483 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLIP2Q9UDT6 1046 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 F5H6K3 240 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 STRNO43815 780 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 GNAT2P19087 354 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 STAT3P40763 770 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLRC3Q07444 240 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCTD2Q14681 263 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 OLFML2BQ68BL8 750 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 GIMAP6Q6P9H5 292 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 RIOX2Q8IUF8 465 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPXCR1Q8N123 301 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIFC2Q96AC6 838 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 CEP95Q96GE4 821 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAML3Q96JK9 1138 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLF1Q9BQI6 1058 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 NACAP1Q9BZK3 213 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC5A4Q9NY91 659 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 NYAP2Q9P242 653 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 MTMR7Q9Y216 660 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 KBTBD13C9JR72 458 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 MSCO60682 206 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC25A27O95847 323 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSPY3P0CV98 308 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSPY8P0CW00 308 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 RTP1P59025 263 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPARAQ07869 468 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 IKQ13123 557 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 VPS53Q5VIR6 699 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 REPS2Q8NFH8 660 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 FERMT2Q96AC1 680 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 GDF15Q99988 308 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 HOMER2Q9NSB8 354 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A0D9SFI3 127 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNM1LO00429 736 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 FOXP2O15409 715 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 SEPT4O43236 478 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 NMT2O60551 498 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGHA2P01877 340 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 NEFLP07196 543 aa8.53□□□□□ -1.04
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