RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GDE1-203ENST00000564172 ICA1Q05084 483 aa20.3■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.3■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.3■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.3■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 SMARCA1P28370 1054 aa20.29■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
GDE1-203ENST00000564172 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.29■□□□□ 0.84
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