RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 TRPV1Q8NER1 839 aa22.37■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 NYAP2Q9P242 653 aa22.37■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 SEPT4O43236 478 aa22.36■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 COBLO75128 1261 aa22.36■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 RASA1P20936 1047 aa22.36■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 CYP2C19P33261 490 aa22.36■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 OSBP2Q969R2 916 aa22.36■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 ATG4CQ96DT6 458 aa22.36■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.35■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.35■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.35■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 REPS2Q8NFH8 660 aa22.35■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.35■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 LTBP2Q14767 1821 aa22.34■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 VWA5AO00534 786 aa22.34■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 FCER1AP12319 257 aa22.34■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.34■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 MKL1Q969V6 931 aa22.34■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 MAML3Q96JK9 1138 aa22.34■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.34■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.33■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 ATP2A1O14983 1001 aa22.33■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.33■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 TDHQ8IZJ6 230 aa22.33■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.33■■□□□ 1.17
LTBR-211ENST00000543190 GPAA1O43292 621 aa22.32■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 SNX17Q15036 470 aa22.32■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 ERC2O15083 957 aa22.31■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 STAT3P40763 770 aa22.31■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.31■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 TICAM2Q86XR7 235 aa22.31■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.31■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.3■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.3■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.3■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 CNGA1P29973 690 aa22.29■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 PLS1Q14651 629 aa22.29■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.29■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.29■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.29■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 F5H6K3 240 aa22.28■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 SYN1P17600 705 aa22.28■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 KLRC3Q07444 240 aa22.28■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.28■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.28■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 TINF2Q9BSI4 451 aa22.28■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 BCL11AQ9H165 835 aa22.28■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 A0A0C4DFX4 3053 aa22.27■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.27■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 KCTD2Q14681 263 aa22.27■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.27■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.27■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.27■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.27■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 LRCH3Q96II8 777 aa22.27■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 MMP19Q99542 508 aa22.27■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.27■■□□□ 1.16
LTBR-211ENST00000543190 MCM3APO60318 1980 aa22.27■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 M0R2C6 588 aa22.26■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 FDX1P10109 184 aa22.26■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 OAZ1P54368 228 aa22.26■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 KBTBD13C9JR72 458 aa22.25■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 NDUFB10O96000 172 aa22.25■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.25■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.25■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.25■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.25■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.24■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.24■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 TTLL1O95922 423 aa22.24■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 TDO2P48775 406 aa22.24■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 LRRC41Q15345 812 aa22.24■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.24■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.24■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 CEP95Q96GE4 821 aa22.24■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.24■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 PHF24Q9UPV7 400 aa22.24■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 PLA2G6O60733 806 aa22.23■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 MX1P20591 662 aa22.23■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 RTP1P59025 263 aa22.23■■□□□ 1.15
LTBR-211ENST00000543190 PDE4BQ07343 736 aa22.23■■□□□ 1.15
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