RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532743.5

RAD51-208, Transcript of RAD51 recombinase, human

TSL 2 BASIC

Gene RAD51, Length 1,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD51-208	ENST00000532743	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		28.89	■■■□□ 2.22
RAD51-208	ENST00000532743	DGKH	Q86XP1	1220 aa		28.89	■■■□□ 2.22
RAD51-208	ENST00000532743	KAT14	Q9H8E8	782 aa		28.89	■■■□□ 2.22
RAD51-208	ENST00000532743	EFCC1	Q9HA90	598 aa		28.89	■■■□□ 2.22
RAD51-208	ENST00000532743	MYPN	Q86TC9	1320 aa		28.89	■■■□□ 2.22
RAD51-208	ENST00000532743	ERICH2	A1L162	156 aa		28.89	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	MCC	P23508	829 aa		28.89	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	PSMC4	P43686	418 aa		28.89	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	CCDC96	Q2M329	555 aa		28.89	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		28.89	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		28.89	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	GMCL1	Q96IK5	515 aa		28.89	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		28.89	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	DSG3	P32926	999 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	FCGRT	P55899	365 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	ERVK-9	P63128	1117 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	ERVK-24	P63145	666 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	LBX2	Q6XYB7	198 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		28.88	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	ATG4C	Q96DT6	458 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		28.87	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	PEX10	O60683	326 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	CHST3	Q7LGC8	479 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	DCAF4	Q8WV16	495 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	FEM1B	Q9UK73	627 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		28.86	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	STAT2	P52630	851 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	CCNA1	P78396	465 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	KCTD1	Q719H9	257 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	MB21D1	Q8N884	522 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	PNMA1	Q8ND90	353 aa		28.85	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	MCM5	P33992	734 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	KRT32	Q14532	448 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	KIFC2	Q96AC6	838 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	CENPF	P49454	3210 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	TMEM232	C9JQI7	657 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	GNRH1	P01148	92 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	PLS1	Q14651	629 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	WTAP	Q15007	396 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	TRIM47	Q96LD4	638 aa		28.84	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	HTT	P42858	3142 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	HSPA4	P34932	840 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	CAP1	Q01518	475 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	TNS4	Q8IZW8	715 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	BTBD7	Q9P203	1132 aa		28.83	■■■□□ 2.21
RAD51-208	ENST00000532743	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	PDHB	P11177	359 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	HOXD10	P28358	340 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	CTGF	P29279	349 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	WDR78	Q5VTH9	848 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	RASEF	Q8IZ41	740 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	ANKS1A	Q92625	1134 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	COA7	Q96BR5	231 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		28.82	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
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RAD51-208	ENST00000532743	CNMD	O75829	334 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	SEC23A	Q15436	765 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		28.81	■■■□□ 2.2
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RAD51-208	ENST00000532743	NEK1	Q96PY6	1258 aa		28.81	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	VWA5A	O00534	786 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	ANTXR2	P58335	489 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743		Q3C1V9	767 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		28.8	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	MAPK4	P31152	587 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	TMEM87B	Q96K49	555 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	PORCN	Q9H237	461 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		28.79	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	ZBED4	O75132	1171 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	MTA3	Q9BTC8	594 aa		28.78	■■■□□ 2.2
RAD51-208	ENST00000532743	USP26	Q9BXU7	913 aa		28.78	■■■□□ 2.2

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