RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 INHAP05111 366 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 MAPK4P31152 587 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 TRIM32Q13049 653 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 PLS1Q14651 629 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 NEDD4P46934 1319 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-211ENST00000531385 FGRP09769 529 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 CCL5P13501 91 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 CHMLP26374 656 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 CCNA1P78396 465 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 MKL1Q969V6 931 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 STX8Q9UNK0 236 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 MTMR7Q9Y216 660 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 MORN1Q5T089 497 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 SLFN13Q68D06 897 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 TRIB2Q92519 343 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 UBXN2AP68543 259 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 CCL14Q16627 93 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 USP6NLQ92738 828 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 ERCC3P19447 782 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 MB21D1Q8N884 522 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 RNF208Q9H0X6 261 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 RAD50Q92878 1312 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 VWA5AO00534 786 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF213O14771 459 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 PTPREP23469 700 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 PTH1RQ03431 593 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 REPS2Q8NFH8 660 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 SHISA4Q96DD7 197 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 HMGCRP04035 888 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 MCCP23508 829 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 RGS2P41220 211 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 MAP2K5Q13163 448 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 KIFC2Q96AC6 838 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 APBA2Q99767 749 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-211ENST00000531385 BMP3P12645 472 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 GRB14Q14449 540 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 KCTD1Q719H9 257 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 B4E1Z4 1266 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 NOVP48745 357 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM232C9JQI7 657 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 SGSM2O43147 1006 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 NEFLP07196 543 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 ADORA2AP29274 412 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 SLC1A4P43007 532 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 SLC4A3P48751 1232 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 DEFB118Q96PH6 123 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 FEM1BQ9UK73 627 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 KDM4AO75164 1064 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 GJB1P08034 283 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 STAT3P40763 770 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 CCDC96Q2M329 555 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 CPXCR1Q8N123 301 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 ESR2Q92731 530 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRU-211ENST00000531385 GMCL1Q96IK5 515 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms