RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531006.1

TSTA3-213, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-213ENST00000531006 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TSTA3-213ENST00000531006 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.4■■□□□ 1.5
TSTA3-213ENST00000531006 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
TSTA3-213ENST00000531006 TSPY2A6NKD2 308 aa24.39■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 TTLL1O95922 423 aa24.39■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 SKAP1Q86WV1 359 aa24.39■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 MKL1Q969V6 931 aa24.39■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 IL25Q9H293 177 aa24.39■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.39■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 HIP1O00291 1037 aa24.38■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 MORN1Q5T089 497 aa24.38■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.38■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 NBPF3Q9H094 633 aa24.38■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.38■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 CCL14Q16627 93 aa24.37■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 TRIB2Q92519 343 aa24.37■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 USP6NLQ92738 828 aa24.37■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 ORC4O43929 436 aa24.36■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 PTPREP23469 700 aa24.36■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.36■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 MTMR7Q9Y216 660 aa24.36■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.36■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.35■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 FGRP09769 529 aa24.35■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 ERCC3P19447 782 aa24.35■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 SLFN13Q68D06 897 aa24.35■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.35■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.35■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.35■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.35■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 STX8Q9UNK0 236 aa24.35■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 VWA5AO00534 786 aa24.34■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 HMGCRP04035 888 aa24.34■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 RGS2P41220 211 aa24.34■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 MAP2K5Q13163 448 aa24.34■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.34■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 MB21D1Q8N884 522 aa24.34■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.34■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.33■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 ZNF213O14771 459 aa24.33■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 GJB1P08034 283 aa24.33■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 MCCP23508 829 aa24.33■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.33■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.33■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 SHISA4Q96DD7 197 aa24.33■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 DEFB118Q96PH6 123 aa24.33■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.33■■□□□ 1.49
TSTA3-213ENST00000531006 ZMYM6O95789 1325 aa24.33■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 CHMLP26374 656 aa24.32■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 SLC4A3P48751 1232 aa24.32■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.32■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa24.32■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.32■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 KIFC2Q96AC6 838 aa24.32■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.32■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 BMP3P12645 472 aa24.31■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 GJA8P48165 433 aa24.31■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 REPS2Q8NFH8 660 aa24.31■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 STAT3P40763 770 aa24.3■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 GRB14Q14449 540 aa24.3■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.3■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.3■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 APBA2Q99767 749 aa24.3■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.3■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 NEDD4P46934 1319 aa24.3■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 LAMA4Q16363 1823 aa24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 TMEM232C9JQI7 657 aa24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 SGPL1O95470 568 aa24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 ADORA2AP29274 412 aa24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 KCTD1Q719H9 257 aa24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 DPP9Q86TI2 863 aa24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 CPXCR1Q8N123 301 aa24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 MROH8Q9H579 483 aa24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 FEM1BQ9UK73 627 aa24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 COBLO75128 1261 aa24.28■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 SLC1A4P43007 532 aa24.28■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 PTH1RQ03431 593 aa24.28■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.28■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 RPTORQ8N122 1335 aa24.28■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 STRNO43815 780 aa24.27■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 ZBED4O75132 1171 aa24.27■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 SNAP25P60880 206 aa24.27■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TSTA3-213ENST00000531006 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms