RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511907.1

CTBP1-211, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTBP1, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-211ENST00000511907 SMC5Q8IY18 1101 aa23.06■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.06■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 NYAP2Q9P242 653 aa23.06■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.05■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 FOXP2O15409 715 aa23.05■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.05■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.05■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 ADORA2AP29274 412 aa23.04■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 PDE4BQ07343 736 aa23.04■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.04■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.04■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 VPS53Q5VIR6 699 aa23.04■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.04■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 DPP9Q86TI2 863 aa23.04■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 CEP95Q96GE4 821 aa23.04■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 CEP290O15078 2479 aa23.04■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.03■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 F5H6K3 240 aa23.03■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 NDUFB10O96000 172 aa23.03■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 HOXC6P09630 235 aa23.03■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 TSPY3P0CV98 308 aa23.03■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 TSPY8P0CW00 308 aa23.03■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 KLRC3Q07444 240 aa23.03■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.03■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.03■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 FAM227BQ96M60 508 aa23.03■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 OGDHLQ9ULD0 1010 aa23.03■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.03■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.03■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 A0A0D9SFI3 127 aa23.02■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 STRNO43815 780 aa23.02■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.02■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.02■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 MROH8Q9H579 483 aa23.02■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.02■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.02■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.02■■□□□ 1.28
CTBP1-211ENST00000511907 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.01■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 VWA5AO00534 786 aa23.01■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 CYP2C19P33261 490 aa23.01■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 TFAP4Q01664 338 aa23.01■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 RILPL2Q969X0 211 aa23.01■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 EVI5O60447 810 aa23■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 COBLO75128 1261 aa23■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 TTLL1O95922 423 aa23■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 NUCB1Q02818 461 aa23■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 LHX8Q68G74 356 aa23■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 NEDD1Q8NHV4 660 aa23■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 SLF1Q9BQI6 1058 aa23■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 NBPF3Q9H094 633 aa23■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 INCENPQ9NQS7 918 aa23■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 SLC25A27O95847 323 aa22.99■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 CNGA1P29973 690 aa22.99■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 STAT3P40763 770 aa22.99■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.99■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 REPS2Q8NFH8 660 aa22.99■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 MKL1Q969V6 931 aa22.99■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.99■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.99■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 FCER1AP12319 257 aa22.98■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.98■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.98■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.98■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.271e-7■■■■□ 24.2
CTBP1-211ENST00000511907 TSPY2A6NKD2 308 aa22.97■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.97■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.97■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 TRPV1Q8NER1 839 aa22.97■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.97■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 MMP19Q99542 508 aa22.97■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.97■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.97■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 IGHA2P01877 340 aa22.96■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 SLFN13Q68D06 897 aa22.96■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.96■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 KIFC2Q96AC6 838 aa22.96■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTBP1-211ENST00000511907 PFASO15067 1338 aa22.95■■□□□ 1.26
CTBP1-211ENST00000511907 NMT2O60551 498 aa22.95■■□□□ 1.26
CTBP1-211ENST00000511907 PGK2P07205 417 aa22.95■■□□□ 1.26
CTBP1-211ENST00000511907 CYBAP13498 195 aa22.95■■□□□ 1.26
CTBP1-211ENST00000511907 SLC4A3P48751 1232 aa22.95■■□□□ 1.26
CTBP1-211ENST00000511907 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CTBP1-211ENST00000511907 ALX1Q15699 326 aa22.95■■□□□ 1.26
CTBP1-211ENST00000511907 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CTBP1-211ENST00000511907 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.95■■□□□ 1.26
CTBP1-211ENST00000511907 MAML3Q96JK9 1138 aa22.95■■□□□ 1.26
CTBP1-211ENST00000511907 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.2 ms