RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 OLFML2BQ68BL8 750 aa29.48■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 FSD1Q9BTV5 496 aa29.48■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 SLC5A4Q9NY91 659 aa29.48■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 MX1P20591 662 aa29.47■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM132BQ14DG7 1078 aa29.47■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 ABRAQ8N0Z2 381 aa29.47■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF287Q9HBT7 754 aa29.47■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 FBXO28Q9NVF7 368 aa29.47■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 A0A1W2PPC1 479 aa29.46■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 SLC25A27O95847 323 aa29.46■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 IGHA2P01877 340 aa29.46■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 CYBAP13498 195 aa29.46■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 FAM83BQ5T0W9 1011 aa29.46■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa29.46■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa29.46■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 MYH4Q9Y623 1939 aa29.45■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 COBLO75128 1261 aa29.45■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 NACAP1Q9BZK3 213 aa29.45■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 NYAP2Q9P242 653 aa29.45■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 STAP2Q9UGK3 403 aa29.45■■■□□ 2.31
ALYREF-203ENST00000511412 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 FCER1AP12319 257 aa29.44■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 IFNL3Q8IZI9 196 aa29.44■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 TRPV1Q8NER1 839 aa29.44■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 CRBNQ96SW2 442 aa29.44■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 VWA5AO00534 786 aa29.43■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 PRDM1O75626 825 aa29.42■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 RIOX2Q8IUF8 465 aa29.42■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 SALL3Q9BXA9 1300 aa29.42■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa29.41■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 SYN1P17600 705 aa29.41■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 COPB2P35606 906 aa29.41■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa29.41■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 MMP19Q99542 508 aa29.41■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 GDF15Q99988 308 aa29.41■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 SLF1Q9BQI6 1058 aa29.41■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 NAPBQ9H115 298 aa29.41■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 F5H6K3 240 aa29.4■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 NDUFB10O96000 172 aa29.4■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 STAT3P40763 770 aa29.4■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 KLRC3Q07444 240 aa29.4■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC26Q2I0M4 334 aa29.4■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD45Q5TZF3 282 aa29.4■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 REPS2Q8NFH8 660 aa29.4■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 MAML3Q96JK9 1138 aa29.4■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 CLIP2Q9UDT6 1046 aa29.4■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa29.4■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 PLIN4Q96Q06 1357 aa29.39■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 DNM1LO00429 736 aa29.39■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 KCTD2Q14681 263 aa29.39■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 CEP95Q96GE4 821 aa29.39■■■□□ 2.3
ALYREF-203ENST00000511412 SEPT4O43236 478 aa29.38■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 BMP8BP34820 402 aa29.38■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 PDE4BQ07343 736 aa29.38■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 PPARAQ07869 468 aa29.37■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 MTMR4Q9NYA4 1195 aa29.37■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa29.37■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 TTLL1O95922 423 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 TSPY3P0CV98 308 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 TSPY8P0CW00 308 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 TEX13BQ9BXU2 312 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 SZT2Q5T011 3432 aa29.36■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 PGK2P07205 417 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 ANO1Q5XXA6 986 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 MKL1Q969V6 931 aa29.35■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 ARRDC4Q8NCT1 418 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 NEDD1Q8NHV4 660 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 EVI5LQ96CN4 794 aa29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 KBTBD13C9JR72 458 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 NRBP1Q9UHY1 535 aa29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF792Q3KQV3 632 aa29.32■■■□□ 2.28
ALYREF-203ENST00000511412 FAM47AQ5JRC9 791 aa29.32■■■□□ 2.28
ALYREF-203ENST00000511412 KIFC2Q96AC6 838 aa29.32■■■□□ 2.28
ALYREF-203ENST00000511412 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
ALYREF-203ENST00000511412 FEM1BQ9UK73 627 aa29.32■■■□□ 2.28
ALYREF-203ENST00000511412 ZBED4O75132 1171 aa29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-203ENST00000511412 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
ALYREF-203ENST00000511412 PDE1AP54750 535 aa29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms