RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MKL1Q969V6 931 aa18.02■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LNPKQ9C0E8 428 aa18.02■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NBPF3Q9H094 633 aa18.02■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLIP2Q9UDT6 1046 aa18.02■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa18.02■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VWA5AO00534 786 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRDM1O75626 825 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSPY3P0CV98 308 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSPY8P0CW00 308 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADORA2AP29274 412 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM83BQ5T0W9 1011 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NCAPG2Q86XI2 1143 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NEDD1Q8NHV4 660 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MTMR4Q9NYA4 1195 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TTLL1O95922 423 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FCER1AP12319 257 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COPB2P35606 906 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM132BQ14DG7 1078 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OLFML2BQ68BL8 750 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHD1LQ86WJ1 897 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EXOC6Q8TAG9 804 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NPLOC4Q8TAT6 608 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEP95Q96GE4 821 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXO28Q9NVF7 368 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FLRT1Q9NZU1 646 aa18■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EVI5O60447 810 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MSCO60682 206 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NDUFB10O96000 172 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGHDP01880 384 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STAT3P40763 770 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TFAP4Q01664 338 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUCB1Q02818 461 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ALX1Q15699 326 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LHX8Q68G74 356 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RIOX2Q8IUF8 465 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLF1Q9BQI6 1058 aa17.99■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FOXP2O15409 715 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGHA2P01877 340 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OSBPL3Q9H4L5 887 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C11orf49Q9H6J7 331 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANAPC4Q9UJX5 808 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLIN4Q96Q06 1357 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RLFQ13129 1914 aa17.98■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COBLO75128 1261 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYP2C19P33261 490 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FEM1BQ9UK73 627 aa17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEP290O15078 2479 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBED4O75132 1171 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CNGA1P29973 690 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCTD2Q14681 263 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM47AQ5JRC9 791 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 REPS2Q8NFH8 660 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RILPL2Q969X0 211 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM227BQ96M60 508 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TEX13BQ9BXU2 312 aa17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP17.96■□□□□ 0.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A0G2JMZ2 1700 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSPY2A6NKD2 308 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP2A1O14983 1001 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FDX1P10109 184 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CTDSPL2Q05D32 466 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VPS53Q5VIR6 699 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MMP19Q99542 508 aa17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A0D9SFI3 127 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ORC4O43929 436 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FGAP02671 866 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FGRP09769 529 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BMP3P12645 472 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYBAP13498 195 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLFN13Q68D06 897 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GMCL1Q96IK5 515 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAML3Q96JK9 1138 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NRBP1Q9UHY1 535 aa17.94■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF236Q9UL36 1845 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COL6A1P12109 1028 aa17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms