RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 DCTPP1Q9H773 170 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM132BQ14DG7 1078 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 GIMAP6Q6P9H5 292 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 KBTBD3Q8NAB2 608 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 ARRDC4Q8NCT1 418 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-210ENST00000489601 SEPT4O43236 478 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 FCER1AP12319 257 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 GOPCQ9HD26 462 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 GSG1L2A8MUP6 293 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 RIOX2Q8IUF8 465 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 MAML3Q96JK9 1138 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 COL6A3P12111 3177 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 VWA5AO00534 786 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 APPBP2Q92624 585 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 OSBP2Q969R2 916 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 GPATCH3Q96I76 525 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 FBXO28Q9NVF7 368 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 MYH4Q9Y623 1939 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 ROBO3Q96MS0 1386 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 RASA1P20936 1047 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 STAT3P40763 770 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM83BQ5T0W9 1011 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 MMP19Q99542 508 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 MKNK2Q9HBH9 465 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 NYAP2Q9P242 653 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 NRBP1Q9UHY1 535 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 KBTBD13C9JR72 458 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 COPB2P35606 906 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 RTP1P59025 263 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 ANO1Q5XXA6 986 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 REPS2Q8NFH8 660 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 MINDY4BA8MYZ0 360 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 GPAA1O43292 621 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 RAD21O60216 631 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 GNAT2P19087 354 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF792Q3KQV3 632 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 KCTD2Q14681 263 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 LRRC41Q15345 812 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 DEFB123Q8N688 67 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 TINF2Q9BSI4 451 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP4-210ENST00000489601 LTBP2Q14767 1821 aa19.83■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 F5H6K3 240 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 PGK2P07205 417 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 KLRC3Q07444 240 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 SNX17Q15036 470 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 TSHZ3Q63HK5 1081 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 STK11IPQ8N1F8 1099 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 SLF1Q9BQI6 1058 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF287Q9HBT7 754 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 TTC41PQ6P2S7 1318 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 NDUFB10O96000 172 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM47AQ5JRC9 791 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 C1orf53Q5VUE5 145 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 MKL1Q969V6 931 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 M0R2C6 588 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 ATP2A1O14983 1001 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 RARBP10826 455 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 TDO2P48775 406 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 TEX13BQ9BXU2 312 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 CLIP2Q9UDT6 1046 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 ERC2O15083 957 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 ADCYAP1R1P41586 468 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 Q7L0L9 218 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 IFNL3Q8IZI9 196 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC17A8Q8NDX2 589 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 MTMR10Q9NXD2 777 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 PHF24Q9UPV7 400 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 APPP05067 770 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 TRIM60Q495X7 471 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 PI4K2BQ8TCG2 481 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-210ENST00000489601 CEP95Q96GE4 821 aa19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms