RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.62□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 PAPPAQ13219 1627 aa6.61□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 ABCC11Q96J66 1382 aa6.61□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 DRD2P14416 443 aa6.61□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 POLD1P28340 1107 aa6.61□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 IKBKEQ14164 716 aa6.61□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 DDB1Q16531 1140 aa6.61□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.61□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.61□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 LRRC37A3O60309 1634 aa6.61□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 A0A096LPE4 126 aa6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 A0A1W2PPZ6 126 aa6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 TIAF1O95411 115 aa6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 TSPAN15O95858 294 aa6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 CTSWP56202 376 aa6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 MLANAQ16655 118 aa6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 FBF1Q8TES7 1133 aa6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 TCF12Q99081 682 aa6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.59□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 FUT4P22083 530 aa6.59□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 MAPK8P45983 427 aa6.59□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 ATP2B2Q01814 1243 aa6.59□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.59□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.59□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.59□□□□□ -1.35
CNN3-206ENST00000487539 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.59□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa6.58□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.58□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 GPRASP1Q5JY77 1395 aa6.58□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 KIF1BO60333 1816 aa6.58□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa6.58□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 METTL12A8MUP2 240 aa6.58□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 INHBBP09529 407 aa6.58□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 GRIA4P48058 902 aa6.58□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.58□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.58□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.58□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.58□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 PPLO60437 1756 aa6.58□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 CD8BP10966 210 aa6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 ITPKAP23677 461 aa6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 FGD1P98174 961 aa6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 CYP27A1Q02318 531 aa6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 PCDH1Q08174 1060 aa6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 SMIM5Q71RC9 77 aa6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 HOMEZQ8IX15 550 aa6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 PRAM1Q96QH2 718 aa6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.56□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.56□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 FOXN1O15353 648 aa6.56□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 GRM2Q14416 872 aa6.56□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.56□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 HGSNATQ68CP4 663 aa6.56□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.56□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.56□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 ABCB6Q9NP58 842 aa6.56□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 BCL9O00512 1426 aa6.56□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 CRB1P82279 1406 aa6.56□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.56□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.56□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.55□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 GIPC1O14908 333 aa6.55□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 RGL3Q3MIN7 710 aa6.55□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CNN3-206ENST00000487539 ABHD8Q96I13 439 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms