RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485941.2

NBPF3-211, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NBPF3, Length 921 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-211ENST00000485941 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa28.02■■■□□ 2.08
NBPF3-211ENST00000485941 NCAPG2Q86XI2 1143 aa28.02■■■□□ 2.08
NBPF3-211ENST00000485941 KANSL2Q9H9L4 492 aa28.02■■■□□ 2.08
NBPF3-211ENST00000485941 MYH7P12883 1935 aa28.02■■■□□ 2.08
NBPF3-211ENST00000485941 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
NBPF3-211ENST00000485941 PLS1Q14651 629 aa28.01■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 RIOX2Q8IUF8 465 aa28.01■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.01■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 DLL1O00548 723 aa28■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 SLC25A27O95847 323 aa28■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 SLC5A4Q9NY91 659 aa28■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 UNC80Q8N2C7 3258 aa28■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 FCER1AP12319 257 aa27.99■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 LRRC41Q15345 812 aa27.99■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 C20orf194Q5TEA3 1177 aa27.99■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 C1orf53Q5VUE5 145 aa27.99■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 BCL11AQ9H165 835 aa27.99■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 NRBP1Q9UHY1 535 aa27.99■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa27.99■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 VWA5AO00534 786 aa27.98■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF792Q3KQV3 632 aa27.98■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 SBK1Q52WX2 424 aa27.98■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 FAM47AQ5JRC9 791 aa27.98■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 LRRCC1Q9C099 1032 aa27.98■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 SMCHD1A6NHR9 2005 aa27.97■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 GSG1L2A8MUP6 293 aa27.96■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.96■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.96■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa27.96■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 ROBO3Q96MS0 1386 aa27.96■■■□□ 2.07
NBPF3-211ENST00000485941 KBTBD13C9JR72 458 aa27.95■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 PGK2P07205 417 aa27.95■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 RASA1P20936 1047 aa27.95■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 STAT3P40763 770 aa27.95■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 ADCYAP1R1P41586 468 aa27.95■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 TRIM60Q495X7 471 aa27.95■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 AMOTL1Q8IY63 956 aa27.95■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 GUCD1Q96NT3 240 aa27.95■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 TINF2Q9BSI4 451 aa27.95■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 PDLIM7Q9NR12 457 aa27.95■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 FAM83BQ5T0W9 1011 aa27.94■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 GIMAP6Q6P9H5 292 aa27.94■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 OSBP2Q969R2 916 aa27.94■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 MMP19Q99542 508 aa27.94■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 GOPCQ9HD26 462 aa27.94■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 PHF24Q9UPV7 400 aa27.94■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa27.93■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 TRIM43BA6NCK2 446 aa27.93■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa27.93■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.93■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 ECHDC1Q9NTX5 307 aa27.93■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 NYAP2Q9P242 653 aa27.93■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 CUL9Q8IWT3 2517 aa27.93■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 SHHQ15465 462 aa27.92■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 KBTBD3Q8NAB2 608 aa27.92■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 C9orf50Q5SZB4 431 aa27.91■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 FERMT2Q96AC1 680 aa27.91■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa27.91■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 EYSQ5T1H1 3165 aa27.91■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa27.91■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 KCTD2Q14681 263 aa27.9■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 BADQ92934 168 aa27.9■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 DCTPP1Q9H773 170 aa27.9■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa27.9■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 RIPK3Q9Y572 518 aa27.9■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa27.89■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 F5H6K3 240 aa27.89■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 ADAMTS4O75173 837 aa27.89■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 ITGB8P26012 769 aa27.89■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 COPB2P35606 906 aa27.89■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 TLE2Q04725 743 aa27.89■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 KLRC3Q07444 240 aa27.89■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP27.89■■■□□ 2.06
NBPF3-211ENST00000485941 CDH23Q9H251 3354 aa27.88■■■□□ 2.05
NBPF3-211ENST00000485941 ATP2A1O14983 1001 aa27.88■■■□□ 2.05
NBPF3-211ENST00000485941 NDUFB10O96000 172 aa27.88■■■□□ 2.05
NBPF3-211ENST00000485941 PGK1P00558 417 aa27.88■■■□□ 2.05
NBPF3-211ENST00000485941 RARBP10826 455 aa27.88■■■□□ 2.05
NBPF3-211ENST00000485941 APPBP2Q92624 585 aa27.88■■■□□ 2.05
NBPF3-211ENST00000485941 MKL1Q969V6 931 aa27.88■■■□□ 2.05
NBPF3-211ENST00000485941 SLF1Q9BQI6 1058 aa27.88■■■□□ 2.05
NBPF3-211ENST00000485941 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa27.87■■■□□ 2.05
NBPF3-211ENST00000485941 TEX13BQ9BXU2 312 aa27.87■■■□□ 2.05
NBPF3-211ENST00000485941 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms