RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 PRO3102Q9H379 93 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 PFASO15067 1338 aa24.06■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 SYN1P17600 705 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 RASA1P20936 1047 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 COPB2P35606 906 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 MMP19Q99542 508 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 NYAP2Q9P242 653 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 MYH4Q9Y623 1939 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 CEP290O15078 2479 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 M0R2C6 588 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 COL6A1P12109 1028 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 MX1P20591 662 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 KCTD2Q14681 263 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.04■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 COBLO75128 1261 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 CYBAP13498 195 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 STAT3P40763 770 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 PDE4BQ07343 736 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 NAPBQ9H115 298 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 F5H6K3 240 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 DNM1LO00429 736 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 VWA5AO00534 786 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 BMP8BP34820 402 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 KLRC3Q07444 240 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 RIOX2Q8IUF8 465 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-212ENST00000484841 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 KBTBD13C9JR72 458 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 TRPV1Q8NER1 839 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 MAML3Q96JK9 1138 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 GDF15Q99988 308 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 SEPT4O43236 478 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 PRDM1O75626 825 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 TSPY3P0CV98 308 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 TSPY8P0CW00 308 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 LRRC26Q2I0M4 334 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 ZBED4O75132 1171 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 NDUFB10O96000 172 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 SLC4A3P48751 1232 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 ANO1Q5XXA6 986 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 TTLL1O95922 423 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 CRBNQ96SW2 442 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 IGHA2P01877 340 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 PGK2P07205 417 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 DDX11Q96FC9 970 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 CEP95Q96GE4 821 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 PPARAQ07869 468 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 CPXCR1Q8N123 301 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 KIFC2Q96AC6 838 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 FEM1BQ9UK73 627 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-212ENST00000484841 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 TFAP4Q01664 338 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 TDHQ8IZJ6 230 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 MKL1Q969V6 931 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 EVI5LQ96CN4 794 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 TINF2Q9BSI4 451 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms